热休克富集技术与琼脂深层培养法联用:低成本高选择性分离土壤中梭菌(Clostridium)的新策略

【字体: 时间:2025年06月06日 来源:Journal of Microbiological Methods 1.7

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  本研究针对梭菌(Clostridium)分离需昂贵厌氧设备的难题,开发了结合热休克富集(筛选芽孢形成菌)与琼脂深层培养(筛选严格厌氧菌)的低成本方法。从8个地点土壤样本中成功分离出11种新梭菌,占已报道梭菌总数的7.5%,为生物燃料生产和癌症治疗研究提供了重要菌种资源。

  

在追求可持续发展的全球背景下,梭菌(Clostridium)因其独特的生物学特性成为多领域研究热点。这类严格厌氧菌既能通过丙酮-丁醇-乙醇(ABE)发酵生产生物燃料,又能作为癌症基因治疗的载体,其产氢能力还可助力碳中和。然而,传统分离方法依赖价格高昂的厌氧培养箱,成为阻碍相关研究的瓶颈。

埼玉工业大学清洁能源项目组创新性地将物理筛选(热休克)与培养策略(琼脂深层)相结合,建立了一套无需特殊设备的梭菌分离方案。研究团队通过70°C热处理20分钟有效杀灭非芽孢菌(如大肠杆菌E. coli),利用琼脂柱深层培养筛选严格厌氧菌,最终从0.2g土壤样本中分离到3个属17个菌种,包含11个新梭菌物种。值得注意的是,该方法获得的菌株数量占已知梭菌种类的7.5%,远超传统厌氧罐培养效率。

关键技术包括:1)热休克处理(70°C/20分钟)筛选芽孢形成菌;2)强化梭菌培养基(RCM)琼脂深层培养;3)通过产气特征鉴别目标菌落。实验证实,梭菌(如C. butyricum)在热处理后存活率达31.7%,显著高于枯草芽孢杆菌(B. subtilis)的0.6%。

【微生物菌株与培养基组成】
采用RCM培养基(含0.05%L-半胱氨酸盐酸盐作为还原剂),对比验证了5种对照菌株的耐热性,确立70°C为最佳筛选温度。

【耐热性测试】
定量分析显示,梭菌芽孢耐热性比B. subtilis高5,000倍,为热休克富集提供理论依据。

【讨论】
传统厌氧培养箱法存在好氧菌污染风险,而新方法通过双重筛选显著提高特异性。分离到的C. carboxidivorans等菌株具备CO转化乙醇能力,对生物燃料开发具有特殊价值。

【结论】
该研究突破设备限制,为资源有限的实验室开展梭菌研究提供可行方案。所获菌株库不仅涵盖ABE发酵、产氢等工业菌种,还包含可用于CDEPT(梭菌导向酶前药治疗)的C. sporogenes,为生物医学与能源领域研究开辟了新途径。作者团队特别指出,该方法在肠道菌群研究中同样具有应用潜力,未来或可加速癌症微环境调控菌株的发掘。

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