基于rDNA序列分析的棘阿米巴属(Acanthamoeba)新型谱系发现及其系统发育研究

研究人员通过挖掘GenBank数据库，对棘阿米巴属(Acanthamoeba)及其近缘种的rDNA序列进行系统性筛查，发现18S/LSU rDNA序列中存在多个高度分化的新谱系，包括棘阿米巴库氏组(A. culbertsoni)和米氏组(A. micheli)的新基因型，以及可能代表原棘阿米巴属(Protacanthamoeba)、卢阿佩莱阿米巴属(Luapeleamoeba)或棘阿米巴科(Acanthamoebidae)新物种的近基部谱系。该研究为拓展病原性自由生活阿米巴的多样性认知提供了分子证据。

　　

分子证据揭示棘阿米巴属(Acanthamoeba)存在远超预期的遗传多样性。这项研究通过分析GenBank中的核糖体DNA(rDNA)数据，在机会性致病菌棘阿米巴及其近缘种中发现了多个新颖的分子谱系。

研究团队鉴定出包含18S和/或大亚基(LSU)rDNA的片段序列，这些序列不仅揭示了棘阿米巴库氏组(A. culbertsoni)和米氏组(A. micheli)中尚未记录的基因型，更发现了若干缺乏形态学数据的近基部进化支。值得注意的是，部分序列可能指向棘阿米巴科(Acanthamoebidae)中的新成员——包括原棘阿米巴属(Protacanthamoeba)、卢阿佩莱阿米巴属(Luapeleamoeba)或其他近缘物种。

系统发育分析显示，这些高度分化的rDNA序列在进化树中形成稳定分支，强烈暗示其代表新的生物学实体。鉴于棘阿米巴属及其近缘类群的多样性持续扩展，研究者强调需要分离这些菌株以开展形态学与致病性研究，这对完善病原性自由生活阿米巴的分类体系和临床诊断具有重要意义。