多模态综合基因组与免疫图谱检测策略优化组织利用并显著提升临床相关生物标志物检出率

这篇综述展示了多模态综合基因组与免疫图谱检测（CGIP）策略在20,645例实体瘤样本中的应用成效。通过整合DNA/RNA测序（NGS）、基因表达谱（GEP）和PD-L1免疫组化（IHC），实现了99.8%的检测成功率，61%的病例检出Tier 1临床意义生物标志物（如EGFRL858R 、MSI-H），8天中位报告周期为精准医疗提供高效支持。

　　

背景
随着靶向治疗和免疫治疗的快速发展，分子检测已成为晚期肿瘤诊疗的核心环节。然而，组织样本有限性与生物标志物多样性之间的矛盾日益凸显。多模态综合基因组与免疫图谱检测（CGIP）策略通过整合DNA/RNA测序（NGS）、RNA基因表达谱（GEP）和PD-L1免疫组化（IHC），在CAP/CLIA认证实验室中对20,645例实体瘤样本展开研究，旨在解决这一临床痛点。

方法
研究采用TruSight^?
Oncology 500（TSO500）panel进行523基因DNA测序和55基因RNA融合检测，同时通过Oncomine?平台分析395个免疫相关基因表达。创新性采用truXTRAC^?
FFPE共提取技术，实现单次提取完成DNA/RNA双组学分析。生物标志物临床意义严格遵循AMP/ASCO/CAP三级分类标准，其中Tier 1包括FDA批准疗法相关标志（如EGFR^ex19del
）和PD-L1 CPS≥10等IHC结果。

结果
检测成功率呈现梯度差异：PD-L1 IHC达99.8%，而RNA-NGS为87.7%。在15,815例完整数据中，61%检出Tier 1标志物，其中11.4%仅通过PD-L1 IHC阳性锁定治疗机会。值得注意的是，MET^ex14
跳跃突变38.3%需RNA测序辅助检出，凸显多模态价值。基因组特征分析显示：MSI-H在结直肠癌（8.2%）、子宫内膜癌（12.1%）中富集；TMB-H（>10 mut/Mb）在黑色素瘤（55.4%）和非小细胞肺癌（NSCLC）（45%）高发。与AACR GENIE数据库对比显示，本策略在NTRK融合（0.3%）、RET重排（1.1%）等罕见事件检出更具优势。

讨论
该策略突破传统单组学局限：DNA测序主导SNV/CNV检出（94.1%），而RNA测序贡献5.9%的融合基因（如EML4-ALK）。免疫微环境分析揭示PD-L1 CPS≥1的胃癌患者中，CD8⁺
T细胞标志物GZMB表达显著升高（p<0.01），为联合治疗提供线索。自动化核酸提取技术使中位检测周期压缩至8天，较传统序贯检测节省40%组织消耗。

结论
多模态CGIP策略实现"一石三鸟"：组织利用率提升（仅7.7%样本无临床意义发现）、检测通量优化（日处理200+样本）、临床转化加速（88.8%病例匹配Tier 2以上标志物）。随着ADC药物伴随诊断需求激增，这种整合基因组、转录组和蛋白组的多维检测范式，将成为精准肿瘤学的标准配置。