第105位甘氨酸突变导致A类β-内酰胺酶对克拉维酸和阿维巴坦耐药机制研究

【字体: 时间:2025年06月09日 来源:Journal of Biological Chemistry 4.0

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  本研究针对β-内酰胺酶介导的抗生素耐药性这一全球健康威胁,通过位点饱和诱变和深度测序技术,系统研究了A类β-内酰胺酶中"守门员"残基(Ambler position 105)在抑制剂耐药性中的作用。研究发现I105R和Y105G突变可显著降低对克拉维酸(CA)和阿维巴坦(AVI)的敏感性,揭示了该位点作为潜在突变热点的分子机制,为新型β-内酰胺酶抑制剂设计提供了重要理论依据。

  

抗生素耐药性已成为全球公共卫生领域的重大挑战,其中β-内酰胺酶介导的耐药机制尤为突出。这类酶能水解β-内酰胺类抗生素的核心结构,导致药物失效。尽管临床上已开发出β-内酰胺酶抑制剂如克拉维酸(CA)和阿维巴坦(AVI)等,但细菌通过酶突变产生的耐药性仍在不断进化。在这一背景下,理解β-内酰胺酶关键残基的突变如何导致抑制剂耐药,对开发新一代抗生素组合具有重要意义。

Leiden大学的研究团队在《Journal of Biological Chemistry》发表的研究聚焦于A类β-内酰胺酶中一个关键"守门员"残基(Ambler position 105)。通过位点饱和诱变结合深度测序技术,研究人员系统分析了五种代表性A类β-内酰胺酶(BlaC、CTX-M-14、KPC-2、NmcA和TEM-1)在该位点的突变效应。研究采用最小抑菌浓度(MIC)测定、酶动力学分析、X射线晶体学和核磁共振(NMR)等技术手段,全面评估了不同突变对酶活性、稳定性和抑制剂敏感性的影响。

在"底物和抑制剂敏感性"部分,研究发现不同A类β-内酰胺酶对β-内酰胺抗生素和抑制剂的敏感性存在显著差异。特别是携带SDN基序(Ser130-Asp131-Asn132)的酶对阿维巴坦更为敏感,而BlaC(含SGD基序)则表现出更强的固有耐药性。这一结果为理解不同β-内酰胺酶的抑制剂敏感性差异提供了分子基础。

"守门员残基文库的深度测序"结果显示,大多数105位点的突变对酶功能产生负面影响,但Gly和Arg突变却展现出独特的优势。特别是在BlaC中,I105R突变不仅提高了对碳青霉烯类抗生素的活性,还显著降低了对克拉维酸和阿维巴坦的敏感性。类似地,在CTX-M-14和TEM-1中,Y105G突变也导致了对两种抑制剂的交叉耐药。

"抑制剂耐药性与活性权衡"部分通过详细的酶动力学分析揭示了突变体的生化特性。BlaC I105R对碳青霉烯的催化效率(kcat
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)提高了2.7倍,但对硝基头孢菌素和氨苄西林的活性降低。抑制动力学模拟表明,I105R突变主要通过降低抑制剂结合亲和力(Ki
增加5倍)而非改变催化步骤来产生耐药性。

"Tyr→Gly取代促进TEM-1稳定性"的研究发现,Y105G突变意外地提高了TEM-1的热稳定性(ΔTm
+3°C),这解释了为何尽管催化效率下降,但突变体仍能维持较高的细菌耐药性。Rosetta稳定性预测进一步支持了这一实验结果。

通过"Ile→Arg突变导致BlaC活性位点扩大"的结构生物学研究,晶体结构显示I105R突变导致活性位点入口扩大,Arg105侧链向外移动。与抑制剂复合物的结构表明,这种构象变化可能影响抑制剂的结合和转化。NMR化学位移扰动(CSP)分析证实突变主要影响102-106环区,与晶体结构观察一致。

在讨论部分,作者强调105位点作为"守门员"残基在A类β-内酰胺酶功能进化中的核心作用。该研究首次报道了CTX-M和TEM家族酶中105位点突变导致的阿维巴坦耐药,为临床可能出现的耐药突变提供了预警。特别值得注意的是,Y105G突变在保持酶稳定性的同时产生广谱抑制剂耐药,这种"稳定性-耐药性"的独特平衡可能成为临床耐药菌株的潜在进化路径。

这项研究的意义在于:首先,系统阐明了105位点作为A类β-内酰胺酶关键进化热点的作用机制;其次,发现了不同家族β-内酰胺酶通过相似突变产生交叉耐药性的共同规律;最后,为设计不依赖105位点相互作用的新一代β-内酰胺酶抑制剂提供了重要理论依据。这些发现将有助于指导未来抗生素组合的开发和临床应用策略的优化。

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