科索沃地区结核分枝杆菌种群遗传结构的首次解析及其流行病学意义

本研究针对科索沃这一欧洲结核病高发区（发病率33/10万），首次采用间隔区寡核苷酸分型（Spoligotyping）和全基因组测序（WGS）技术，系统分析了2021-2022年184例结核分枝杆菌（M. tuberculosis）临床分离株的遗传特征。研究发现93.5%菌株属于Euro-American谱系（Lineage 4），同时检出5株East-Asian谱系（Lineage 2）和1株山羊分枝杆菌（M. caprae），并通过WGS证实了3组传播链（SNP<12）。该研究填补了巴尔干地区结核菌分子流行病学空白，为跨境传播监测提供了关键基线数据。

　　

结核病至今仍是全球最致命的传染病之一，而在欧洲的科索沃地区，其发病率高达33/10万，位居欧洲前列。这个经历过战争和人口大规模迁移的巴尔干国家，结核病防控面临独特挑战：难民集中居住可能加速传播，治疗中断可能诱发耐药性，但此前该地区结核分枝杆菌的遗传特征却从未被系统研究过。这种知识空白使得公共卫生部门难以区分本地传播与输入病例，也无法评估耐药菌株的演化风险。

来自波兰国家科学中心资助的研究团队在《Journal of Clinical Tuberculosis and Other Mycobacterial Diseases》发表了一项开创性工作。研究人员收集了2021-2022年间科索沃全国26个地区的184例结核菌临床分离株，采用间隔区寡核苷酸分型（Spoligotyping）进行初步分型，对特殊谱系菌株进一步开展全基因组测序（WGS），结合生物信息学工具SAM-TB进行系统发育分析，最终绘制出该国结核菌种群的首张精细遗传图谱。

3.1 患者特征
研究纳入的患者中58%为男性，40%集中在60岁以上年龄组，地域分布显示首都普里什蒂纳占比最高（39%）。这些人口统计学特征与科索沃国家结核病登记数据高度吻合，证实样本具有代表性。

3.2 耐药谱
令人意外的是，仅3%菌株显示耐药性，远低于全球5%的MDR-TB平均水平。其中2株耐利福平（Rifampicin），2株耐异烟肼（Isoniazid），3株耐乙胺丁醇（Ethambutol），且耐药菌株间无流行病学关联。这一结果提示科索沃可能尚未形成耐药克隆传播，但需警惕此前报道的14.5%治疗中断率可能带来的潜在风险。

3.3 Spoligotyping分型
通过43个间隔区标志物分析，发现49株（26.6%）属于SIT53型（特征序列777777760771），这是欧洲最常见的结核菌谱系。值得注意的是：

• 检出5株East-Asian谱系（SIT1），其地理分布分散，暗示可能为独立输入病例
• 5株SIT2型菌株被TB-Lineage工具误判为East-African-Indian谱系，经WGS确认为Euro-American谱系
• 发现26种新型或"孤儿"型别，包括1株人源山羊分枝杆菌（M. caprae），提示可能存在动物传人感染

3.4 全基因组测序
对10株特殊谱系菌株的WGS分析（平均覆盖深度250×）揭示：

• 3组密切相关的传播链（SNP差异<12），其中2对和1组三联体
• 虚拟Spoligotyping与实验分型结果100%吻合，验证了实验可靠性
• SNP系统发育树显示SIT1型菌株存在2个亚群（SNP差异0-3 vs 11-150）

这项研究首次系统描绘了科索沃结核菌的遗传多样性图谱，其科学价值体现在三个维度：首先，确认Euro-American谱系（Lineage 4）的绝对优势（93.5%），其中SIT53型可能源于历史人口迁移；其次，发现East-Asian谱系（Lineage 2）的输入病例，为跨境传播监测提供分子标记；最后，WGS揭示的传播链证明本地传播仍在持续。特别值得注意的是，研究团队开发的"Spoligotyping+靶向WGS"策略，为资源有限地区开展精准分子流行病学研究提供了可推广的技术路线。

该研究的公共卫生意义尤为突出：一方面，基线数据的建立使未来监测能够区分新发传播与历史遗留感染；另一方面，发现的M. caprae病例提示需要加强人畜共患监测。随着科索沃大量侨民在欧洲各国的季节性往返，这些数据还将为全欧范围内的结核病防控提供关键节点信息。正如作者强调，这项工作只是起点，未来需要扩大采样范围和监测时长，特别是对耐药突变积累的动态追踪，才能真正筑起巴尔干地区的结核病防控网络。