基于机器学习的微塑料污染环境中抗生素降解菌群变化预测研究

【字体: 时间:2025年06月09日 来源:Journal of Environmental Chemical Engineering 7.4

编辑推荐:

  微塑料(MPs)与抗生素复合污染日益严重,但MPs理化特性如何调控抗生素降解菌群尚不明确。研究人员通过随机森林等机器学习算法,首次预测了MPs特性(浓度、环境基质等)对核心菌群(如Proteobacteria)的影响机制,发现MPs浓度与菌群丰度呈非线性依赖关系,为复杂环境中抗生素生物降解预测提供了新工具。

  

在全球环境面临微塑料(Microplastics, MPs)与抗生素复合污染威胁的背景下,这些直径小于5 mm的塑料颗粒因其巨大比表面积和强疏水性,成为污染物传播的"特洛伊木马"。更令人担忧的是,抗生素在医疗和养殖业的滥用已导致全球年消耗量逼近20万吨,而MPs的存在可能进一步干扰自然界中本已脆弱的抗生素降解过程。尽管已知某些细菌如Achromobacter、Bacillus等具有降解抗生素的能力,但MPs的复杂特性(如粒径、浓度、环境基质)如何影响这些"环境清道夫"的生存与功能,始终是悬而未决的科学难题。

中国某研究机构团队在《Journal of Environmental Chemical Engineering》发表的研究,创新性地采用机器学习方法破解这一生态黑箱。研究人员通过Web of Science系统收集185组数据片段,筛选6个关键变量,运用随机森林(Random Forest)、支持向量机等算法构建预测模型。特别引入SHAP(Shapley additive explanation)算法解析特征重要性,结合PDP(partial dependency plot)分析揭示变量与菌群响应的非线性关系。

Dataset collection and feature selection
研究锁定Actinobacteria、Proteobacteria等7个与抗生素降解显著相关的核心菌门(p<0.05),这些菌群在降解过程中丰度显著提升。例如,Actinobacteria在阿莫西林降解中占主导地位,而Proteobacteria则通过周质空间捕获机制增强四环素降解效率。

Statistical analysis of dataset before modeling
随机森林模型在群落分布和丰度波动预测中表现最优,AUC值分别达85%和88%。特征重要性分析揭示:污染位点是影响群落分布的首要因素(贡献度34%),而MPs浓度则主导丰度波动(贡献度28%)。值得注意的是,Proteobacteria、Bacteroidetes和Firmicutes对MPs表现出特殊敏感性。

Conclusion
研究首次证实MPs通过改变表面微生境偏好性和理化特性重塑核心菌群。当MPs浓度低于100 mg/kg时,菌群依赖性随浓度增加而增强;超过该阈值后,毒性效应导致依赖性减弱。这种"低促高抑"的浓度效应为解释不同研究中菌群响应差异提供了统一框架。

该研究的突破性在于将机器学习引入环境微生物生态学研究,不仅准确预测了MPs特性与降解菌群的复杂关系,更发现环境基质(土壤/水体)的选择比MPs类型(PE/PS等)对菌群的影响更大。这为精准调控MPs污染环境中的抗生素降解效率提供了理论依据,对维护生态安全和人类健康具有深远意义。

相关新闻
生物通微信公众号
微信
新浪微博
  • 急聘职位
  • 高薪职位

知名企业招聘

热点排行

    今日动态 | 人才市场 | 新技术专栏 | 中国科学人 | 云展台 | BioHot | 云讲堂直播 | 会展中心 | 特价专栏 | 技术快讯 | 免费试用

    版权所有 生物通

    Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

    联系信箱:

    粤ICP备09063491号