哥本哈根医院生物样本库-慢性炎症性疾病（CHB-CID:IBD）队列：遗传与临床数据整合推动炎症性肠病精准医疗

这篇综述系统介绍了哥本哈根医院生物样本库-慢性炎症性肠病（CHB-CID:IBD）队列的构建与价值。该队列整合了32.7万例丹麦人群的遗传（全基因组芯片分型）和临床数据（包括ICD10诊断、生物制剂治疗及手术记录），聚焦克罗恩病（CD）和溃疡性结肠炎（UC）的异质性研究。通过多源数据（丹麦国家患者登记系统、电子健康档案）和四大子队列（CHB/DBDS/DRB/TARCID）联动，为探索基因-环境互作、优化个体化治疗（如TNF-α抑制剂响应预测）提供了独特资源。

　　

背景与理论基础
炎症性肠病（IBD）作为复杂的慢性胃肠道疾病，其发病机制涉及200余个遗传变异（如NFκB通路基因）与环境因素（如吸烟、饮食）的交互作用。全球发病率持续上升（0.3%-0.8%），但现有治疗（如TNFi）响应率不足且副作用显著，凸显大规模队列研究的必要性。

研究设计与人群特征
CHB-CID:IBD队列覆盖丹麦五大医疗区域（图1），包含10,626例IBD患者（CD:5,317例，UC:5,309例）和31.4万非IBD对照。通过四大子队列协同：

1. CHB子队列（2009年启动）：基于常规血液检测剩余样本，含6,030例IBD患者；
2. DBDS子队列（2010年启动）：健康献血者中检出585例IBD，体现"健康献血者效应"；
3. DRB子队列（2015年启动）：关注风湿病共病（149例IBD）；
4. TARCID子队列（2009年启动）：4,214例接受TNFi治疗患者。

诊断依据ICD8/ICD10标准（需≥2次登记验证），阳性预测值达95%。队列中IBD患者首次确诊平均年龄42.3岁（CD早于UC，P=3.2×10^–18
），女性占比54.0%。

数据维度与技术亮点

• 遗传数据：采用Illumina芯片分型，经deCODE遗传学中心基于5万例全基因组参考面板进行插补，包含≈1,800万变异（MAF>1%）。通过亲缘关系分析（KING算法）排除重复样本，发现1,883例IBD患者存在一级/二级亲属对照（图3），为家族研究提供资源。
• 临床数据：整合丹麦国家患者登记系统（1977年起）、实验室数据库（2008年起）及电子病历（BigTempHealth文本挖掘），涵盖：
  • 疾病活动指标：粪便钙卫蛋白（IBD组中位数1210 mg/kg vs 对照107.3 mg/kg，P<2.4×10^–225
    ）；
  • 治疗响应：25.6%患者接受生物制剂（CD达33.2%）；
  • 手术干预：45.2%行肠道相关手术（CD以肠切除为主，UC以全结肠切除多见）；
  • 共病谱：IBD患者中银屑病性关节炎（ICD10:M07）和消化系统疾病（非IBD类）发生率显著增高（图4）。

科研产出与应用前景
该队列已支撑多项发现：

1. 鉴定IL-12/IL-18通路基因与UC患者TNFi耐药相关；
2. 揭示TLR5变异对CD治疗响应的调控；
3. 通过跨疾病分析（如类风湿关节炎）发现共享遗传风险位点。

未来可通过多组学数据（如DBDS血浆蛋白质组）和基因型召回研究深化机制解析。尽管存在生活方式数据缺失的局限，但其规模化和纵向更新特性（截至2023年5月）为IBD分子分型、风险预测模型构建奠定了不可替代的基础。

数据共享机制
合作申请需经指导委员会评估，联系人包括Vibeke Andersen（TARCID）和Ole Birger Vesterager Pedersen（CHB/DBDS）。队列数据可与国际资源（FinnGen、UK Biobank）互补，推动全球IBD精准医疗进程。