七种灵长类端粒到端粒基因组中串联重复序列的演化动态与功能解析

来自国际团队的研究人员利用最新T2T（端粒到端粒）测序技术，首次系统解析了7种灵长类（含人类）基因组中1-100 nt（核苷酸）串联重复序列(TRs)的分布特征，发现大猩猩TR密度最高(69 kb/Mbp)，揭示32 nt物种特异性A/T富集基序对亚端粒重复的贡献，并破解了6种猿类Y染色体五聚体重复的精细结构，为神经退行性疾病STR（短串联重复）异常扩展机制研究提供全新基因组资源。

　　

串联重复序列(TRs)作为基因组中普遍存在的高多态性低复杂度区域，其长度变异（尤其是短串联重复STRs）与基因表达调控、基因组三维结构等关键生物学过程密切相关。人类某些STR位点的异常扩展已被证实与神经退行性疾病存在关联。然而传统参考基因组存在的缺口严重阻碍了TRs的系统研究。随着高通量测序技术的突破，研究者首次获得包括人类在内的7种灵长类完整T2T（telomere-to-telomere）基因组数据。

分析显示：1-100核苷酸(nt)基序的TRs在灵长类大型基因组中占比达3.5%-6.9%，其中大猩猩呈现最高分布密度（每兆碱基含69千碱基TR序列）。值得注意的是，大基序尺寸TRs不仅广泛存在，更在高级有序重复结构中发挥重要作用。研究特别报道了一个具有物种特异性的32 nt A/T富集基序，该基序在亚端粒重复区域扮演关键角色。此外，团队通过基序解构分析，首次揭示6种猿类Y染色体五聚体重复的精细亚结构。

这项突破性工作不仅阐明了TRs在大型基因组中的动态演化规律，更彰显了完整基因组序列在解析低复杂度序列生物学功能中的不可替代价值，为STR相关疾病的机制研究开辟了新视角。