莫斯科城市公园黑线姬鼠主要组织相容性复合体(MHC)等位基因多样性及其适应性进化研究

为解决城市环境中哺乳动物高寄生虫负荷导致的免疫压力问题，研究人员对莫斯科4个公园的黑线姬鼠群体开展主要组织相容性复合体(MHC) DRB基因外显子2的等位基因多样性研究。通过Illumina NovaSeq 6000平台扩增子测序发现27个等位基因，其中Bitsevskii公园等低城市化区域呈现更高基因多样性，而高度城市化的Neskuchnyi Garden出现抗原结合位点特异性选择现象，揭示了不同城市化程度下MHC适应性进化差异。

　　

在城市生态系统中，哺乳动物面临寄生虫负荷等多重胁迫因素，主要组织相容性复合体(Major Histocompatibility Complex, MHC)基因的多样性成为评估种群免疫适应力的关键指标。研究团队聚焦莫斯科城市公园的黑线姬鼠(Apodemus agrarius)群体，采用Illumina NovaSeq 6000高通量测序技术对MHC II类DRB基因的第二外显子进行深度解析。

结果揭示27个独特等位基因的分布图谱，其中9个与普通田鼠存在跨物种保守性。最具生态学意义的是：在城市化梯度最低的Bitsevskii公园——该区域保持着小型哺乳动物多物种群落——检测到最高水平的等位基因多样性（含多个特有变异）和最复杂的个体基因型组合；而高度城市化的Neskuchnyi Garden则表现出强烈的自然选择特征，所有保留的等位基因均编码具有独特抗原结合位点(antigen-binding site)的氨基酸序列。

空间分析显示，莫斯科河右岸（Neskuchnyi Garden与Bitsevskii公园）和左岸（Terletskii公园与主植物园）的种群分别呈现遗传相似性，暗示历史地理隔离对基因流动的影响。这些发现为理解城市化压力下免疫基因的适应性进化提供了分子生态学证据，证实MHC多态性模式可作为评估野生动物群体对环境胁迫响应能力的生物标记。