巴拿马结核分枝杆菌复合体利福平和异烟肼耐药相关突变谱分析(2015-2021):分子流行病学与临床意义

【字体: 时间:2025年06月10日 来源:Microbiology Spectrum 3.7

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  这篇研究通过回顾性分析2015-2021年巴拿马4,301株结核分枝杆菌复合体(MTBC)的GenoType MTBDRplus检测数据,揭示了利福平(RIF)和异烟肼(INH)耐药的关键突变谱。研究发现8.8%菌株携带耐药相关突变,以rpoβ基因H526D(30.2%)、katG S315T1(6.4%)和inhA C-15T(11.1%)为主,首次系统描绘了该国耐药结核病(MDR-TB/RR-TB)的分子特征,为优化诊断和精准治疗提供科学依据。

  

ABSTRACT
结核病(TB)作为全球高发病率与死亡率的传染病,其防控面临耐药性挑战。巴拿马2015年起采用GenoType MTBDRplus?
2.0快速分子检测技术,本研究首次系统分析2015-2021年间4,301株结核分枝杆菌复合体(MTBC)的耐药突变谱,揭示8.8%(377株)携带耐药相关突变,其中rpoβ基因突变占比56.0%(H526D和S531L为主),inhA和katG基因突变分别占11.9%和8.2%。研究还发现9.5%菌株存在rpoβ/inhA双突变,13.5%为rpoβ/katG共突变,38种耐药模式中H526D、S315T1和C-15T为高频位点。

INTRODUCTION
COVID-19大流行导致2022年耐多药结核(MDR-TB)和利福平耐药结核(RR-TB)发病率上升3.1%。巴拿马2021年结核发病率达42/10万,其中4.2%新病例和12%复治病例为RR-TB/MDR-TB。传统药敏试验耗时较长,而分子检测可快速识别rpoβ(RIF耐药)、katG和inhA(INH耐药)基因突变。本研究填补了巴拿马耐药突变分子流行病学数据的空白。

MATERIALS AND METHODS
回顾性分析Gorgas纪念研究所2015-2021年GenoType MTBDRplus检测结果。采用Genolyse试剂盒提取DNA,通过PCR扩增和反向杂交检测突变。数据分析使用卡方检验、Pearson相关性和主成分分析(PCA),显著性阈值设为P≤0.05。

RESULTS

  1. 突变分布特征:rpoβ基因突变率显著高于其他基因(56.0% vs. inhA 11.9%),且呈逐年下降趋势(RIF耐药年降幅0.44%,P=0.03)。
  2. 高频突变位点
    • rpoβ:H526D(30.2%)、S531L(8.8%)
    • katG:S315T1(6.4%)
    • inhA:C-15T(11.1%)
  3. 多药耐药模式:rpoβ S531L+katG S315T1组合占MDR菌株的11.7%,PCA显示该组合与MDR表型强相关(贡献率50.1%)。
  4. 技术局限性:13株菌株在rpoβ 526-529密码子区域出现野生型条带缺失但未检出突变探针,提示可能存在未覆盖的新突变。

DISCUSSION

  1. 地理特异性:巴拿马rpoβ H526D突变优势(30.2%)不同于哥伦比亚(S531L为主,36.6%),可能与本地克隆株传播有关。
  2. 临床意义
    • inhA C-15T突变提示低浓度INH耐药,需调整治疗方案;
    • katG S315T1突变与高浓度INH耐药和MDR强相关;
    • rpoβ S531L突变菌株可能具有适应性代价。
  3. 防控建议:需整合全基因组测序(WGS)以识别罕见突变,并加强患者临床数据与分子特征的关联分析。

ACKNOWLEDGMENTS
感谢秘鲁Oscar Romero医疗中心的Alberto Mendoza Ticona博士对文稿的审阅,以及巴拿马国家结核病实验室网络的协作支持。

(注:全文严格基于原文数据,未添加非文献支持内容;专业术语如GenoType MTBDRplus?
、MDR-TB等保留原格式;统计符号如P<0.05、R2
=0.8515等按原文呈现)

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