"微杆菌噬菌体Casino基因组测序揭示EM1亚簇新型裂解机制及治疗潜力"

来自康涅狄格大学和夏威夷大学马诺阿分校的研究团队报道了新型放线菌噬菌体Casino的完整基因组特征。该研究通过Illumina测序和生物信息学分析，揭示这个感染微杆菌(Microbacterium foliorum)的EM1亚簇噬菌体具有53,667 bp环形基因组，含48个预测基因（33.3%获功能注释），其独特的双向转录模式与结构基因布局为噬菌体治疗提供了新的分子靶点。

　　

在斯托尔斯（美国康涅狄格州）的居民区土壤样本中，科学家们捕获了一种名为Casino的噬菌体新兵。这个隶属于EM1亚簇的"细菌猎手"展现出典型的裂解特性，其环形基因组如同精密的分子瑞士军刀——53,667个碱基对以64.8%的GC含量紧密排列，编码着48个功能各异的基因模块。

通过Illumina MiSeq平台产生的382,391条测序读数，如同高倍显微镜般将基因组细节放大1012倍。生物信息学工具箱（PECAAN、Phamerator^v3
、Glimmer^v3.02B
）的联合作业揭示了有趣的基因组架构：前半段部署着DNA聚合酶I、Cas4核酸酶等"分子手术刀"，后半段则装配着噬菌体"纳米注射器"——包括门户蛋白、尾鞘组件和细胞壁爆破专家Lysin A。

值得注意的是，这个符合短尾噬菌体(podovirus)形态特征的基因组暗藏玄机：32个"神秘基因"（占66.7%）的功能仍待破译，就像未解密的生物武器图纸。其与同类EM1亚簇噬菌体共享的"双向转录高速公路"特征，为理解噬菌体进化提供了新的路标。

这项由SEA-PHAGES计划孵化的发现，不仅扩充了噬菌体治疗(phage therapy)的武器库，更暗示着土壤微生物圈中还有无数这样的"天然抗生素工厂"等待发掘。从GPS坐标41.78307°N的普通泥土到冷冻电镜下的纳米级杀手，Casino的基因组图谱为对抗耐药菌危机打开了新的战略室。