法国刺猬冠状病毒（EriCoV）全基因组测序揭示其与MERS-CoV的系统发育关联及生态意义

【编辑推荐】来自法国的研究团队通过对欧洲刺猬(Erinaceus europaeus)直肠拭子样本进行测序，获得两株刺猬冠状病毒(EriCoV)的完整编码基因组（30.1kb，GC含量37.6%）。该研究采用RNA-Seq和de novo 组装技术，证实EriCoV属于β冠状病毒属(Betacoronavirus)的Merbecovirus亚属，与MERS-CoV及蝙蝠冠状病毒亲缘密切，为跨物种传播风险研究提供关键数据。

　　

在法国图卢兹和迈松阿尔福采集的欧洲刺猬直肠拭子中，科学家成功解析出两株刺猬冠状病毒(EriCoV)的完整编码基因组。这种隶属于β冠状病毒属(Betacoronavirus)、Merbecovirus亚属的病毒，其30.1kb的基因组结构与德国等地分离株高度相似（相似度93.6%），GC含量稳定在37.5%左右。

研究采用创新性的实验策略：先用特异性引物(PanCov Pol 15197/15635)扩增RdRp基因，再通过Illumina双端测序获得1500万条reads。经过Trimmomatic质控和RNA SPAdes^{de novo}
组装，最终注释出典型的冠状病毒基因结构——包括ORF1ab、刺突蛋白(S)、囊膜蛋白(E)、膜蛋白(M)和核衣壳蛋白(N)基因，以及与致病性相关的附属蛋白ORF3a/4a/4b/5/8b。

值得注意的是，系统发育分析显示EriCoV与引发人类中东呼吸综合征的MERS-CoV及多种蝙蝠冠状病毒聚为一支。虽然目前该病毒仅在欧洲和中国刺猬中检出且呈无症状感染，但其跨物种传播潜力值得警惕。这项由法国国家兽医学院主导的研究，为野生动物源冠状病毒的生态监测提供了重要基线数据。