尼日利亚土壤中分离的皮特不动杆菌高质量基因组草图揭示多重耐药基因谱

来自尼日利亚的研究团队通过对Gwagwalada地区土壤中分离的6株皮特不动杆菌(Acinetobacter pittii)进行全基因组测序，获得3.73-3.95 Mb的高质量基因组草图(完整度99.99%-100%)。研究发现这些环境菌株携带adeFGH/adeIJK等外排泵基因、OXA-417型β-内酰胺酶及ADC变异体等AMR基因，为理解该机会致病菌的生态适应性和临床耐药机制提供了重要数据。

　　

革兰阴性非发酵菌不动杆菌属(Acinetobacter)广泛分布于自然和临床环境。作为醋酸钙-鲍曼不动杆菌复合体的成员，皮特不动杆菌(A. pittii)正逐渐成为具有重要临床意义的条件致病菌。研究团队从尼日利亚Gwagwalada不同生态位点(包括动物棚舍、草原和蚁丘)采集土壤样本，通过铬显色培养基和血平板分离获得6株菌株。

采用Illumina NextSeq平台(2×300 bp)进行测序，SPAdes算法组装获得基因组草图。这些3.73-3.95 Mb的基因组显示38.84%-38.97%的GC含量，包含3,532-3,753个编码基因。值得注意的是，所有菌株均携带丰富的耐药基因：包括介导多药外排的ade系列基因(adeF/G/H/I/J/K)、苯扎氯铵耐药基因(abeS/M)、氨基糖苷修饰酶(AmvA)以及新型OXA型β-内酰胺酶(OXA-417)。特别在菌株ABJ_C1_3中检测到457 kb的超长contig，其N50值达114,305 bp，为后续比较基因组研究提供优质数据。

通过fastANI分析确认这些菌株与模式菌株FDAARGOS 1399^T
的ANI值达96.5%-96.6%。该研究首次系统报道了西非环境来源皮特不动杆菌的基因组特征，其携带的ADC-15/21/22/41/43等β-内酰胺酶变异体，暗示了环境菌株可能作为耐药基因的天然储存库。这些发现为理解细菌耐药性在"One Health"框架下的传播进化提供了新视角。