两种聚乙烯醇降解菌株的全基因组测序及降解机制解析

来自日本的研究团队针对聚乙烯醇(PVA)生物降解机制这一环境科学难题，完成了两株高效降解菌株（Rhodanobacter sp. DHB23和Flexivirga endophytica CGMCC 1.15085）的全基因组测序，揭示其分别携带PVADH/SADH/OPH和SADH/OPH降解通路，为塑料污染治理提供了重要菌种资源和理论依据。

　　

这项突破性研究揭示了两种能"吃掉"塑料的神奇细菌。科研人员从日本Ogaki市污水处理厂的活性污泥中，成功分离出两株聚乙烯醇(PVA)降解高手——菌株G1和G2。通过Illumina MiSeq和Oxford Nanopore MinION双平台测序，首次绘制出它们的完整基因组图谱：G1拥有单条4,019,238 bp染色体，而G2除了4,495,174 bp的主染色体外，还携带166,025 bp和63,733 bp两个质粒。

基因解码显示，G1菌株（分类学近缘Rhodanobacter sp.）装备了完整的PVA降解"工具箱"：PVA脱氢酶(PVADH)、三个次级酒精脱氢酶(SADH)和一个氧化PVA水解酶(OPH)。有趣的是，G2菌株（近缘Flexivirga endophytica）虽然缺失PVADH，但保留了多组SADH和OPH基因，暗示其可能存在全新的PVA代谢路径。

研究团队运用fastp、Unicycler等生信工具进行数据清洗和组装，经CheckM2评估基因组完整度高达99.99%。特别引人注目的是，这些菌株在含PVA培养基上形成的透明水解圈，直观证实了它们的降解能力。该发现为开发新型生物降解技术提供了分子靶点，或许某天这些"塑料吞噬者"能帮助我们解决白色污染危机。

（注：所有实验数据已存入DDBJ数据库，登录号AP039674-AP039677）