非马尔可夫量子态扩散理论揭示SARS-CoV-2病毒隧穿感染的量子生物学机制

【字体: 时间:2025年06月10日 来源:Computational and Structural Biotechnology Journal 4.5

编辑推荐:

  本研究针对传统马尔可夫模型在描述病毒-受体强耦合作用时出现非物理负概率的问题,通过建立非马尔可夫量子态扩散(NMQSD)框架,模拟SARS-CoV-2刺突蛋白与ACE2受体间的振动辅助电子隧穿过程。研究发现,在中等和强耦合极限下,电子隧穿概率显著提升,且非马尔可夫动力学能有效避免马尔可夫近似导致的非物理结果,为理解病毒感染量子机制及开发靶向干预策略提供新视角。

  

在生物学与量子物理的交叉领域,传统理论框架对复杂生命过程的解释仍存在显著空白。以嗅觉感知为例,"锁钥模型"难以解释同位素分子的气味差异,而振动辅助电子隧穿理论为此提供了新视角。这种量子生物学现象在酶催化、DNA突变等领域已有验证,但病毒感染的量子机制研究仍属前沿。SARS-CoV-2的全球大流行凸显了理解病毒入侵机制的紧迫性,特别是其刺突蛋白与ACE2受体相互作用的微观动力学。传统马尔可夫模型在强耦合条件下会预测出非物理的负概率,这促使研究人员探索更精确的非马尔可夫量子描述方法。

为解决这一问题,研究人员采用非马尔可夫量子态扩散(NMQSD)方法,构建包含刺突蛋白-ACE2二聚体(模拟为自旋玻色模型)与生物环境相互作用的开放量子系统。通过求解非马尔可夫随机薛定谔方程(SSE),结合洛伦兹型谱密度函数和奥恩斯坦-乌伦贝克噪声模拟,分析不同耦合强度(Δ=0.0001-0.1 eV)下的电子转移概率。研究特别关注836 cm-1
、1040 cm-1
和1240 cm-1
等刺突蛋白特征振动模式的影响。

非马尔可夫量子态扩散
建立包含系统哈密顿量(Hsys
)、Lindblad算符(L)和玻色子浴的NMQSD方程,通过Girsanov变换处理归一化态。关键系数g0
(t)、g1
(t)由环境关联函数α(t,s)导出,其温度依赖性通过Bose-Einstein分布体现。

病毒感染的量子模型
将刺突蛋白-ACE2复合物建模为二能级系统(εD
A
=500-1700 cm-1
),耦合振动模式(ωi
)和膜环境(γiE
=0.005-0.025 eV)。哈密顿量包含受体项(HR
=εσz
/2+Δσx
/2)、蛋白质振动项(HP
=ω(b?
b+1/2))及其相互作用(HR-P
z
Σωi
γi
(bi
+bi
?
))。

结果与讨论

  1. 耦合强度依赖性:弱耦合(Δ=0.0001 eV)时振动模式影响微弱;当Δ增至0.1 eV,隧穿概率提升50%以上,且ΔP=Max[PD→A
    (t)]with
    -Max[PD→A
    (t)]without
    呈现显著正值(图2d)。
  2. 非马尔可夫特征:时间依赖衰减率κ(t)呈现非指数衰减和负值区间(图6),表明环境记忆效应导致粒子数回流,这是马尔可夫模型无法捕捉的关键现象。
  3. 振动模式特异性:1240 cm-1
    模式在强耦合下(ωc
    =0.02Δ)引发最显著布居振荡(图4d),对应C-H键伸缩振动的量子相干增强效应。

这项研究首次将非马尔可夫量子动力学应用于病毒侵染机制,证实振动辅助电子隧穿在SARS-CoV-2感染中的重要作用。理论预测与实验可观测的拉曼光谱特征(如836 cm-1
二硫键振动)高度吻合,为开发基于量子干涉的抗病毒策略(如振动频率靶向抑制剂)奠定基础。研究还提出可通过量子生物电子隧穿(QBET)光谱实时监测刺突蛋白-受体间的电子转移,这为传染病防控提供了跨学科研究范式。

相关新闻
生物通微信公众号
微信
新浪微博
  • 急聘职位
  • 高薪职位

知名企业招聘

热点排行

    今日动态 | 人才市场 | 新技术专栏 | 中国科学人 | 云展台 | BioHot | 云讲堂直播 | 会展中心 | 特价专栏 | 技术快讯 | 免费试用

    版权所有 生物通

    Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

    联系信箱:

    粤ICP备09063491号