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综述:微流控技术在蛋白质相互作用研究中的应用:当前方法、挑战与未来展望
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年06月11日 来源:European Biophysics Journal 2.2
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这篇综述系统阐述了微流控技术(Microfluidics)在蛋白质相互作用研究中的前沿进展,重点介绍了连续流微流控(MDS/FIDA)和液滴微流控技术,及其在生物物理研究、药物发现(如Hsp70-Bag3相互作用)和临床诊断(如HLA抗体检测)中的应用,同时探讨了技术标准化与跨学科整合的挑战。
引言:蛋白质相互作用与微流控技术的崛起
蛋白质作为生命活动的核心执行者,通过约65万种相互作用构成人类相互作用组。传统技术如免疫共沉淀(Co-IP)和表面等离子共振(SPR)受限于样本需求大或固定化干扰,而微流控技术凭借微尺度流体控制、实时分析和单分子灵敏度(如smMDS)成为革新工具。其层流特性可保持蛋白质天然构象,特别适用于研究短暂弱相互作用(如α-突触核蛋白αSyn
寡聚体)。
连续流微流控技术
扩散基技术
微流控扩散尺寸分析(MDS)通过测量蛋白质在层流中的扩散系数,解析其流体力学半径变化。例如,标记的分子伴侣簇蛋白(clusterin)与Aβ42
纤维结合时,尺寸增加揭示了结合化学计量比(Scheidt et al. 2019)。单分子MDS(smMDS)更将检测限推至100 fM,可分辨胰岛素寡聚体异质性(Krainer et al. 2024)。
电泳方法
微自由流电泳(μFFE)通过电场偏转量化蛋白质电泳迁移率,成功区分钙调蛋白(calmodulin)与肌酸激酶B的钙依赖性结合(Herling et al. 2016)。数字免疫传感(DigitISA)整合μFFE与共聚焦显微镜,实现了生物标志物的数字化计数(Krainer et al. 2023)。
液滴系统
液滴微流控将反应封装在皮升级腔室中,结合FRET或荧光偏振检测相互作用。例如,PhaseScan平台通过组合液滴生成多维相图,解析FUS蛋白与RNA的相分离边界(Arter et al. 2022)。在药物筛选中,液滴系统可高通量测试ACE-1抑制剂(Debs et al. 2012)或癌症化疗药物反应(Eduati et al. 2018)。
挑战与未来方向
当前瓶颈包括芯片制造复杂性(如PDMS工艺)、缺乏标准化协议,以及跨学科知识需求。解决方案指向商业化芯片开发与开源协议共享。在生物医学领域,微流控技术在膜蛋白研究(如KvAP离子通道)和早期诊断(如阿尔茨海默病标志物检测)中展现出独特优势,其高灵敏度与低样本消耗特性有望推动精准医疗发展。
结语
从解析淀粉样纤维形成机制到绘制生物分子凝聚体相图,微流控技术正重塑蛋白质相互作用的研究范式。随着技术壁垒的突破,其在基础研究与临床转化中的应用潜力将加速释放。
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