台湾南部医院产金属β-内酰胺酶阴沟肠杆菌复合体克隆传播感染的分子流行病学与临床预后研究

（编辑推荐）本研究揭示了2014-2022年台湾南部某医疗中心碳青霉烯耐药阴沟肠杆菌复合体（CR-ECC）的流行趋势，首次报道NDM-1型ST171和VIM-1型ST78克隆株的暴发，其携带blaNDM-1 /blaVIM-1 基因导致碳青霉烯类完全耐药，住院死亡率高达51.8%，为临床抗感染治疗和院感防控提供关键数据。

　　

ABSTRACT
碳青霉烯耐药阴沟肠杆菌复合体（CR-ECC）已成为全球关注的临床病原体。台湾地区既往研究显示IMP-8是ECC产碳青霉烯酶的主要类型。本研究收集2014-2022年台湾南部某三甲医院对厄他培南、亚胺培南和美罗培南均耐药的ECC临床分离株，通过多位点序列分型（MLST）、hsp60基因测序、β-内酰胺酶基因PCR检测、药敏试验和全基因组测序分析，揭示了CR-ECC的分子流行病学特征。54株引起感染的ECC分离株中，血流感染（37.0%）和下呼吸道感染（25.9%）最常见，粗住院死亡率达51.8%。90.7%的菌株携带碳青霉烯酶基因，bla_IMP-8
仍是最常见基因，而阿米卡星和粘菌素耐药率低于20%。研究首次发现2019年后台湾未报道过的bla_NDM-1
阳性E. hormaechei subsp. xiangfangensis ST171和bla_VIM-1
阳性E. hormaechei subsp. hoffmannii ST78克隆传播，导致碳青霉烯类完全耐药ECC发病率上升。

INTRODUCTION
阴沟肠杆菌复合体（ECC）是医院获得性感染的重要病原体。随着碳青霉烯类耐药（CR）现象加剧，治疗选择日益受限。美国2006-2015年CR-ECC流行率从<1%升至2.5%，台湾地区厄他培南耐药率已达14.9%-24.7%。既往台湾报道的135株产碳青霉烯酶ECC中，133株产IMP-8。本研究针对某院2019年后对三类碳青霉烯均耐药的ECC暴发开展调查。

MATERIALS AND METHODS
菌株来自2014-2022年对厄他培南、亚胺培南和美罗培南均耐药的ECC临床分离株。采用MLST（dnaA等7个管家基因）、hsp60分型、PCR检测β-内酰胺酶基因（包括bla_KPC
、bla_NDM
等），药敏试验采用VITEK 2系统，全基因组测序使用PacBio Sequel IIe平台。临床数据采集包括SOFA评分、感染类型和转归。

RESULTS
54例CR-ECC感染患者平均年龄67.1岁，61.1%为ICU获得性感染。主要感染类型为导管相关血流感染（18例）和呼吸机相关肺炎（8例）。MLST分型显示96.3%为E. hormaechei，包括三个亚种：steigerwaltii（46.3%）、xiangfangensis（31.5%）和hoffmannii（18.5%）。碳青霉烯酶基因检出率90.7%，其中bla_NDM-1
（11株）自2019年出现，2022年占比达53.8%，主要存在于ST171克隆；bla_VIM-1
（6株）则与ST78克隆相关。药敏显示对头孢他啶-阿维巴坦耐药率88.9%，且全部携带金属酶基因。阿米卡星（耐药率14.8%）和粘菌素（耐药率0%）是少数保持活性的药物。

DISCUSSION
本研究首次系统描绘台湾地区CR-ECC的分子流行病学变迁：

1. ST171克隆携带bla_NDM-1
   与越南报道株相似，不同于欧美流行的KPC型ST171；
2. ST78克隆携带bla_VIM-1
   为台湾首次报道，该型在日本和北美曾检出多种碳青霉烯酶基因；
3. 传统IMP-8型菌株仍持续流行，涉及多个ECC亚种。
   临床治疗面临严峻挑战，需考虑头孢地尔或阿维巴坦联合氨曲南等创新方案。研究局限性包括单中心设计和对碳青霉烯完全耐药菌株的选择偏倚。

（注：全文严格依据原文数据，未添加非文献支持内容，专业术语均保留原文格式如bla_NDM-1
等）