"Dehalobacter sp.菌株CP全基因组解析:揭示氯酚厌氧脱卤关键菌群的代谢潜能与生态修复价值"

【字体: 时间:2025年06月11日 来源:Microbiology Resource Announcements 0.7

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  来自中国的研究团队针对氯酚污染治理难题,从沈阳细河沉积物中富集出4-氯酚(4-CP)厌氧脱卤菌群,通过高通量测序技术首次完成优势菌株CP(Dehalobacter属新成员)2.94 Mb环状染色体组装。该菌株携带40个还原性脱卤酶(rdh)基因及氢化酶复合体基因簇,为有机卤化物生物修复提供重要菌种资源。

  

在沈阳细河沉积物(北纬41°39′46″,东经123°6′20″)中,科学家们成功培育出能将4-氯酚(4-CP)转化为苯酚的神奇厌氧菌群。通过Illumina NovaSeq 6000和PacBio Sequel II双平台测序,他们像拼图大师般将菌群中优势菌株CP的基因组完美组装——这个属于Dehalobacter家族的新成员,拥有2.94兆碱基的环形染色体,GC含量44.5%,藏着2831个蛋白质编码基因和40个还原性脱卤酶(rdh)的基因密码。

特别有趣的是,这些rdh基因中13个还自带"定位器"(rdhB基因),能帮助酶蛋白锚定在细胞膜上。菌株CP体内还装备着多套"能量转换器":1个氢化酶-4复合体、4个镍依赖氢化酶和3个NADH依赖的[FeFe]氢化酶,活像微型生物发电站。通过16S rRNA基因比对发现,它与Dehalobacter sp. TCP1菌株相似度高达99.7%,但基因组中独特的rdh基因阵列使其成为降解氯代有机物的潜力新星。

这项研究不仅为环境污染物生物处理提供了优质菌种资源,那些特殊的rdh基因簇更如同埋藏在基因组中的"解毒钥匙",未来或可解锁更多顽固性卤代污染物的治理难题。研究获得国家自然科学基金和辽宁省重点研发计划联合资助,相关数据已提交至NCBI数据库。

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