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罗氏海源菌DL-A基因组草图揭示马拉硫磷降解机制:河流生态系统污染治理新策略
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年06月11日 来源:Microbiology Resource Announcements 0.7
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来自美国乔治亚大学的研究团队针对北奥科尼河中有机磷杀虫剂污染问题,分离出高效降解马拉硫磷的罗氏海源菌(Rossellomorea marisflavi)DL-A菌株,完成4.27 Mb基因组测序(含4,271个CDS),证实其24小时降解41% 1%浓度马拉硫磷的能力,为河流系统生物修复提供关键菌种资源。
在河流生态系统中,微生物多样性对有机污染物(如杀虫剂)的归趋与转化具有决定性作用。最新研究聚焦美国乔治亚州北奥科尼河——这片流经城市、工业区和农业带的多样化水域,科学家们从河水中成功分离出一株黄色色素的细菌DL-A(见图1)。经16S rRNA基因测序(GenBank登录号PV167751)鉴定为罗氏海源菌(Rossellomorea marisflavi),该菌株在30℃条件下24小时内可降解41%的1%浓度马拉硫磷(malathion),展现出卓越的有机磷杀虫剂分解能力。
研究团队采用高通量测序技术(Illumina NovaSeq 6000平台,150 bp双端测序),结合快速DNA建库(Rapid Plus DNA Lib Prep Kit)和精密生物信息学分析流程:包括Fastp质控、SPAdes组装(N50
达415,286 bp)、QUAST评估等,最终获得4.27 Mb的高质量基因组草图(完整度99.34%,GC含量48.23%)。注释显示该基因组包含4,271个编码序列(CDS)、76个tRNA和8个核糖体RNA(5S/16S/23S),为解析其降解通路奠定基础。
这项由美国能源部环境管理办公室资助的研究,不仅揭示了微生物在环境污染物自然衰减中的关键作用,更为开发生物修复技术提供了优质菌种资源和基因组数据库支持。
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