上海ICU环境中携带blaOXA-23 /blaOXA-91 /blaNDM-1 的碳青霉烯耐药鲍曼不动杆菌基因组特征与传播机制研究

为解决ICU环境中碳青霉烯耐药鲍曼不动杆菌（CRAB）的传播与耐药机制问题，上海浦东新区疾控中心等机构研究人员通过比较2019年（疫情前）与2023年（疫情后）上海7家医院ICU环境样本，发现CRAB检出率显著下降（5.60%→2.44%），但出现同时携带blaOXA-23 、blaOXA-91 和blaNDM-1 的泛耐药菌株。研究通过全基因组测序（WGS）和分子分型揭示了ST2_Pasteur/ST208_Oxford为优势克隆，并首次报道ST3329/ST3331新序列型。该成果为医院感染防控提供了关键证据，发表于《Journal of Global Antimicrobial Resistance》。

　　

碳青霉烯耐药鲍曼不动杆菌（CRAB）已成为全球ICU感染防控的"噩梦级"病原体。这类"超级细菌"不仅能长期存活于医疗设备表面，更可怕的是其携带的碳青霉烯酶基因（如bla_OXA-23
、bla_NDM-1
）可水解包括碳青霉烯类在内的几乎所有β-内酰胺抗生素。疫情期间，ICU成为抢救新冠患者的"主战场"，但同时也是耐药菌传播的"温床"——过度使用抗生素与高强度消毒措施形成矛盾张力，使得CRAB的流行病学特征发生微妙变化。上海浦东新区疾控中心联合多家医院的研究团队开展了一项跨越疫情前后的追踪研究，揭示了CRAB在ICU环境中的动态演变规律。

研究人员采用多中心横断面研究设计，采集2019年（疫情前）和2023年（疫情后）上海7家医院ICU的3,156份环境样本。通过基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（MALDI-TOF MS）鉴定菌种，微量肉汤稀释法检测药敏，全基因组测序（WGS）结合PubMLST、Kaptive等生物信息学工具分析基因组特征。重点监测了bla_OXA-23
、bla_NDM-1
等耐药基因的传播机制。

3.1 流行病学研究
研究发现CRAB主要定植于患者直接接触物品（被褥占25%），且2023年检出率显著低于2019年（2.44% vs 5.60%）。值得注意的是，2023年清洁工具（拖把、马桶）的污染率上升，提示日常消毒存在盲区。

3.2 药敏试验
CRAB对哌拉西林/他唑巴坦（TZP）、头孢他啶（CAZ）等β-内酰胺类耐药率>95%，但对米诺环素（MIN）、替加环素（TGC）保持敏感（耐药率<5%）。2023年首次检出2株泛耐药CRAB，且氨基糖苷类耐药率显著下降（如阿米卡星从90.43%降至75%）。

3.3 同源性分析
通过Pasteur和Oxford两种MLST分型方案，发现ST2_Pasteur/ST208_Oxford是绝对优势克隆（93.6%）。cgMLST分析显示该克隆可细分为7个亚型，其中新发现的ST3329_Oxford/ST239_Pasteur与ST3331_Oxford/ST216_Pasteur具有独特进化分支。

3.4 毒力与耐药基因
所有菌株均携带外膜蛋白ompA和adeFGH外排泵基因。KL/OCL分型显示KL2-OCL1（27.2%）和KL9-OCL1（18.4%）为主要荚膜类型。2023年分离的2023-AB023和2023-AB033两株菌同时携带bla_OXA-23
、bla_OXA-91
和bla_NDM-1
，其中bla_NDM-1
位于可水平转移的plasmid_AE581上，两侧存在IS_Aba125
转座酶基因。

3.5 跨区域传播证据
基因组比对发现，上述两株菌与浙江ICU患者分离株DETAB-R21仅差34个SNP，且与马来西亚分离株存在同源性质粒，证实了国际间传播风险。

这项研究首次系统揭示了疫情前后ICU环境CRAB的基因组演变规律：虽然强化感染控制使总体检出率下降，但泛耐药菌株和新型ST型的出现提示耐药进化并未停止。特别是bla_NDM-1
与OXA型碳青霉烯酶的共存，可能通过质粒介导的横向传播引发更严峻的耐药危机。研究为医院精准消毒（如重点清洁患者接触物品）和抗生素管理（优先选用MIN/TGC）提供了循证依据，其建立的基因组监测网络对全球CRAB防控具有示范意义。未来需基于"One Health"理念，持续追踪环境-患者-医护间的耐药菌传播链。