基于SNP标记揭示濒危物种田纳戈伪? 的遗传种群结构与多样性

来自日本的研究团队针对濒危物种东京苦鱼(Pseudorhodeus tanago)的种群保护难题，采用新型MIG-seq技术获取935个核SNP标记，结合mtDNA数据(534bp)，首次系统解析了该物种5个地理隔离的遗传类群，发现2个野生和5个人工种群存在历史/人为混合现象，为ex situ 保护计划提供了精准的遗传管理策略。

　　

这种被称为东京苦鱼（学名Pseudorhodeus tanago）的小型鲤科鱼类，是日本关东地区特有的濒危物种。由于人类活动导致的栖息地丧失，自1970年代起就启动了多种迁地保护(_{ex situ}
conservation)计划。为精准划定保护单元，研究者们突破传统线粒体DNA(mtDNA)和微卫星标记的局限，创新性地采用多重简单序列重复间基因分型测序技术(MIG-seq)，从1991-2023年间采集的37个野生和圈养种群中，成功获取935个核单核苷酸多态性(SNP)标记。

遗传分化指数_FST

分析显示，不同地理种群间存在显著遗传差异。通过主成分分析、混合分析和系统发育重建，首次鉴定出5个具有明确地理界限的遗传分支，其中2个野生种群和5个人工圈养种群被发现存在有趣的"基因鸡尾酒"现象——既包含地质历史变迁导致的自然混合，也混杂了人工保育过程中的非自然基因交流。

这项研究为这种"水中大熊猫"的保护提供了分子导航图：未来重引入计划应当像保护不同血统的熊猫家族那样，严格保持各地理种群的遗传纯正性，同时建立基因监测预警系统。那些携带混合基因组的圈养种群，则需要特别标注"杂交"身份，避免扰乱野生基因库的天然拼图。