新型失巢凋亡相关基因特征预测肝内胆管癌预后及肿瘤微环境的研究

这篇研究通过生物信息学方法鉴定了肝内胆管癌（ICCA）中与失巢凋亡（anoikis）相关的关键基因（EGF/BNIP3/TDGF1），构建了具有独立预后价值的风险模型，并揭示了其与免疫微环境（TME）的显著关联。研究利用TCGA、ICGC和GEO多组学数据，结合WGCNA和CIBERSORT分析，首次将ICCA分为具有差异生存率和免疫特征的A/B亚型，为靶向治疗和免疫联合策略提供了新靶点。

　　

引言

肝内胆管癌（ICCA）作为第二常见的原发性肝癌，5年生存率不足30%，其预后预测和治疗靶点亟待突破。失巢凋亡——一种因细胞脱离基质触发的程序性死亡形式，在ICCA转移中的作用尚不明确。近年研究发现，TGF-β、PDGF-D等因子通过调控肿瘤微环境（TME）影响ICCA进展，而整合素/EGFR通路介导的失巢凋亡抵抗在结直肠癌和胃癌中已有报道。本研究旨在揭示ICCA中失巢凋亡相关基因（ARGs）的分子特征及其免疫调控机制。

材料与方法

研究整合TCGA数据库41例ICCA样本的RNA测序数据，筛选GeneCards中653个ARGs（相关性评分>0.4），通过limma包鉴定差异表达基因（DEGs）。采用WGCNA构建基因共表达网络，利用单变量Cox回归筛选预后基因，并通过LASSO回归优化模型。外部验证采用ICGC和GSE53870数据集。免疫浸润分析使用CIBERSORT算法，单细胞数据来自TISCH数据库的GSE125449。

结果

关键基因鉴定

在TCGA队列中鉴定出129个差异表达的ARGs，其中EGF、BNIP3和TDGF1通过多步筛选成为核心预后基因。拷贝数变异分析显示PLK1存在完全缺失，而BNIP3在CD4⁺
T细胞和巨噬细胞中广泛表达。

分子亚型分析

共识聚类将患者分为A/B亚型：A亚型富集嗅觉转导通路（OLFACTORY_TRANSDUCTION），免疫细胞（如嗜酸性粒细胞、NK细胞）浸润显著，生存率更高；B亚型则高表达视黄醇代谢通路（RETINOL_METABOLISM），呈现"免疫荒漠"特征。

风险模型构建

基于3个基因构建的风险评分模型在训练集（AUC_5年
=1.000）和验证集（AUC_3年
=0.840）均表现优异。Nomogram预测显示，54岁女性高风险患者5年生存率仅33.4%。

免疫微环境特征

低风险组中单核细胞和肥大细胞浸润更显著，而EGF与MHC II类分子呈强正相关（r=0.82）。值得注意的是，BNIP3通过调控线粒体膜电位可能影响CD8⁺
T细胞功能。

讨论

EGF通过激活PI3K/Akt通路促进失巢凋亡抵抗，与肝癌分级正相关；BNIP3作为缺氧诱导因子，其双重作用体现在促凋亡与免疫调节；TDGF1则通过上皮-间质转化（EMT）增强转移潜能。研究创新性地将ARGs特征与免疫治疗响应关联——A亚型可能受益于PD-1/PD-L1抑制剂，而B亚型或需联合溶瘤病毒。

结论

该研究首次建立ICCA失巢凋亡相关基因标签，为预后分层和联合治疗提供新思路。未来需通过类器官模型和前瞻性临床试验验证TDGF1在EMT中的精确机制，以及BNIP3调控TME的时空动态特征。