基于结构设计的新型1,3-噁唑类胆固醇24-羟化酶(CH24H)抑制剂:靶向血红素铁结合域的创新策略

【字体: 时间:2025年06月12日 来源:Bioorganic & Medicinal Chemistry 3.3

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  本研究针对脑特异性细胞色素P450酶CH24H(CYP46A1)开发新型抑制剂,通过结构导向药物设计(SBDD)和配体亲脂效率(LLE)优化,发现强效选择性抑制剂3k(IC50 =4.5 nM)。口服给药后显著降低小鼠脑内24S-羟基胆固醇(24HC)水平,证实1,3-噁唑可作为新型血红素铁结合基团,为CYP酶抑制剂开发提供新思路。

  

胆固醇代谢与神经系统疾病的隐秘关联
胆固醇24-羟化酶(CH24H/CYP46A1)是大脑胆固醇代谢的关键酶,其产物24S-羟基胆固醇(24HC)不仅参与胆固醇外排,还调控NMDA受体等神经信号通路。异常升高的24HC水平与癫痫、阿尔茨海默病等神经系统疾病密切相关。然而,现有CH24H抑制剂如soticlestat(吡啶类)存在结构单一性问题,且传统血红素铁结合基团(如咪唑、三唑)的化学空间亟待拓展。

从"分子剪刀"到"精准制动器"
日本武田制药的研究团队通过结构导向药物设计(SBDD),将1,3-噁唑这一非经典血红素铁结合基团引入CH24H抑制剂开发。基于先导化合物1a(IC50
=23 nM)的骨架跃迁策略,研究人员构建了咪唑并[1,2-a]吡啶-3-甲酰胺衍生物库,并通过配体亲脂效率(LLE)指导优化,最终获得强效抑制剂3k。该成果发表于《Bioorganic & Medicinal Chemistry》,为靶向CYP酶的药物设计提供了新范式。

关键技术方法
研究采用FreeStyle 293-F细胞表达系统制备CH24H酶,通过放射性[14
C]胆固醇转化实验测定抑制活性;利用X射线晶体学解析抑制剂-酶复合物结构(分辨率1.8-2.3 ?);通过LC/MS/MS检测小鼠脑内24HC水平;采用跨物种CYP酶谱(CYP3A4/2C8/2C9/2D6)评估选择性。

从分子设计到生物验证
4.1 先导化合物发现
通过5-6/6-6/7-6稠合杂环筛选,发现吲哚2a(IC50
=7.7 nM)和二氢吲哚2b(IC50
=5.6 nM)活性最佳。晶体结构显示2b通过1,3-噁唑-铁配位和Arg226氢键网络实现双重结合。

4.2 末端酰胺优化
将吗啉替换为桥环吗啉显著提升活性:2,5-桥环3g(IC50
=6.5 nM)和3,5-桥环3k(IC50
=4.5 nM)分别通过填充Phe80/Trp368形成的疏水口袋增强结合力。3k的LLE值达6.9,优于先导化合物1a(LLE=4.4)。

4.3 选择性验证
3k对代谢CYP酶抑制率均<15%(10 μM),而对照化合物3a对CYP3A4抑制率达41%。晶体结构揭示其选择性源于3-氧杂-8-氮杂双环[3.2.1]辛烷独特的空间位阻效应。

4.4 体内药效
口服3k(10 mg/kg)1小时后脑浓度达2.97 μM,8小时使小鼠脑24HC降低22%,与临床候选药soticlestat效果相当。

突破与启示
该研究首次证实1,3-噁唑可作为高效血红素铁结合基团,其氧原子的氢键受体特性与适度亲脂性(ClogP=1.4)形成完美平衡。通过"骨架约束"策略将柔性酰胺锁定为生物活性构象,结合桥环吗啉的三维空间优势,解决了CYP抑制剂选择性难题。未来可拓展至CYP17A1(前列腺癌)、CYP19A1(乳腺癌)等治疗靶点,为代谢性疾病和肿瘤领域提供新工具化合物。

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