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便携式纸基生物传感器开发:快速检测转基因玉米与大豆的现场解决方案
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年06月12日 来源:Biosensors and Bioelectronics 10.7
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本研究针对转基因作物监管中传统检测方法成本高、耗时长且依赖实验室的痛点,开发了基于环介导等温扩增(LAMP)技术的微流控纸基生物传感器(μPAD)。该系统可在60分钟内直接通过叶片粗提物完成RHS1玉米及RR1/RR2大豆的检测,灵敏度达1.0×103 拷贝/反应,成本仅2.9美元/次,为田间转基因检测提供了便携、经济的解决方案。
随着全球转基因作物种植面积持续扩大,如何快速准确地鉴别转基因成分成为保障生物安全、维护贸易合规的核心挑战。传统检测方法如蛋白质侧流层析试纸条(LFD)易受非蛋白表达型转基因干扰,而聚合酶链式反应(PCR)技术虽特异性强却依赖昂贵仪器和DNA纯化步骤,难以在田间场景应用。更棘手的是,像Roundup杂交系统(RHS)这类通过调控CP4-EPSPS基因实现雄性不育的创新技术,以及抗草甘膦大豆RR1/RR2等新一代转基因品种的涌现,对检测技术提出了更高要求。
针对这些技术瓶颈,来自普渡大学的研究团队在《Biosensors and Bioelectronics》发表了一项突破性研究。他们创新性地将环介导等温扩增(LAMP)技术与微流控纸基分析器件(μPAD)相结合,开发出首个可直接检测叶片粗提物的便携式平台。该系统无需DNA纯化步骤,通过优化0.12-0.25%十二烷基硫酸钠(SDS)提取液配方,在65°C恒温条件下60分钟内即可完成检测,成本控制在2.9美元/测试,为转基因监管提供了革命性的现场检测工具。
研究团队运用了四项关键技术:1) 基于PrimerExplorer V5软件设计特异性LAMP引物组,靶向RHS1玉米及RR1/RR2大豆的转基因序列;2) 采用数字PCR(dPCR)精确定量基因组拷贝数;3) 开发集成化μPAD芯片,通过激光切割亚克力板构建防水反应舱;4) 建立基于色度值(NHI)的时程图像分析算法,实现结果客观判读。所有植物样本均由拜耳作物科学公司提供,涵盖转基因及非转基因对照品种。
【基因拷贝数与LAMP引物表征】
通过dPCR验证,RHS1、RR1和RR2在基因组DNA中的拷贝数显著高于叶片粗提物。设计的五组LAMP引物(Corn.control.3、RHS1.8等)均表现出优异特异性,其中RR1.1和RR2.1引物完全避免非特异性扩增,为后续μPAD检测奠定基础。
【荧光定量LAMP性能验证】
qLAMP结果显示,RHS1.8引物仅扩增转基因玉米,而Soy.control.1引物可识别所有大豆样本。琼脂糖凝胶电泳观察到典型的梯形条带,证实LAMP扩增成功。时间峰值分析表明RR1检测最快(31分钟),符合田间快速检测需求。
【比色法LAMP检测限确立】
采用pH指示剂的比色法在30分钟内即可肉眼判读结果。系统对RHS1、RR1和RR2的检测限分别为4.00×102
、2.30×103
和4.00×103
拷贝/反应,显著优于传统PCR方法。
【μPAD芯片集成与优化】
创新设计的亚克力反应舱有效防止交叉污染,预载冻干试剂的纸基条带可在-20°C保存60天。添加海藻糖(11.5% w/v)和牛血清白蛋白(BSA)显著提升反应稳定性,使系统能耐受叶片色素等抑制剂干扰。
【叶片粗提物检测验证】
关键突破在于实现1:7稀释的叶片粗提物直接检测。0.25% SDS(玉米)和0.12% SDS(大豆)的提取方案最优,NHI分析显示所有转基因样本均能在设定阈值内有效识别,ROC曲线下面积(AUC)达1.0,实现100%灵敏度与特异性。
【讨论与结论】
该研究开创性地将μPAD-LAMP技术应用于转基因检测领域,相比现有技术具有三大优势:1) 检测速度提升3倍,且无需复杂设备;2) 成本降低70%,主要耗材为可批量生产的纸基芯片;3) 首次实现叶片粗提物的直接检测,简化前处理流程。研究者特别指出,该系统通过掺入dUTP/尿嘧啶DNA糖基化酶(UDG)体系有效控制气溶胶污染,而甜菜碱添加剂成功克服了RHS1(61.88% GC)等高GC含量靶标的扩增难题。
这项技术的推广将彻底改变转基因作物的监管模式,使种子纯度检测、田间基因漂移监测等关键场景实现"样本进-结果出"的现场化操作。未来通过整合自动图像分析模块和多重检测通道,该平台有望成为转基因检测的新标准方法。正如研究者强调的,这种低成本、易操作的检测策略不仅适用于玉米和大豆,其模块化设计更可扩展至其他转基因作物的检测,为全球生物安全治理提供普适性解决方案。
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