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hsa_circ_0003098与hsa_circ_0013958在肾细胞癌病理机制中的关键作用及诊断价值
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年06月12日 来源:Gene Reports 1.0
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本研究聚焦肾细胞癌(RCC)恶性亚型早期诊断难题,通过实验与生物信息学分析揭示hsa_circ_0003098和hsa_circ_0013958在肿瘤组织中显著低表达,并构建ceRNA网络阐明其通过调控miRNA/mRNA轴影响细胞迁移、信号传导等致癌过程。研究成果为RCC分子机制提供新见解,并证实二者可作为潜在诊断标志物。
肾细胞癌(RCC)占肾脏恶性肿瘤的90%以上,其中透明细胞亚型(ccRCC)预后较差,亟需探索新型分子标志物和治疗靶点。近年来,环状RNA(circRNA)因其稳定环状结构和作为竞争性内源RNA(ceRNA)调控基因表达的潜力成为研究热点。然而,circRNA在RCC中的具体作用机制尚不明确。
法沙医科大学的研究团队针对这一科学问题,首次系统分析了hsa_circ_0003098和hsa_circ_0013958在RCC中的表达特征和功能机制。通过采集40对RCC患者肿瘤与癌旁组织样本,结合qRT-PCR、生物信息学分析和生存预测模型,发现这两种circRNA在肿瘤组织中显著下调,且与患者肾脏基础疾病和肿瘤亚型显著相关。进一步构建的ceRNA网络揭示其通过吸附miRNA调控关键致癌通路,包括细胞周期、Wnt信号传导和上皮-间质转化(EMT)相关基因。
关键技术方法包括:1)从伊朗设拉子Shahid Faghihi医院获取临床样本队列;2)qRT-PCR定量circRNA表达;3)通过CircInteractome、TargetScan等数据库预测miRNA-mRNA相互作用;4)使用GEPIA进行生存分析;5)Cytoscape可视化ceRNA网络。
【研究结果】
hsa_circ_0003098与hsa_circ_0013958在肿瘤组织中的表达水平
qRT-PCR显示两者在肿瘤组织中表达量分别降低至正常组织的0.013倍和<0.001倍,具有统计学显著性。
临床特征相关性
hsa_circ_0013958低表达与患者基础肾病(p=0.008)和特定肿瘤亚型显著相关,提示其临床分型价值。
ceRNA网络分析
鉴定出miR-182-5p、miR-217等关键miRNA节点,其靶向的CDH1(E-cadherin)、CCND1等mRNA与细胞粘附和周期调控直接相关。
生存分析
ceRNA网络中的核心基因如VEGFA、EGFR的高表达与患者总生存期缩短显著相关(p<0.05)。
诊断效能评估
ROC曲线证实hsa_circ_0003098(AUC=0.82)和hsa_circ_0013958(AUC=0.79)具有良好诊断区分度。
【结论与意义】
该研究首次阐明hsa_circ_0003098/0013958通过ceRNA机制参与RCC发生发展,其表达下调导致miRNA海绵功能丧失,进而解除对致癌基因的抑制。这不仅为理解RCC表观遗传调控提供新视角,更因其稳定的环状结构和组织特异性,为液体活检标志物开发奠定基础。作者Hosein Mansoori等强调,后续需扩大样本验证其在不同RCC亚型中的普适性,并探索circRNA靶向治疗的可行性。论文发表于《Gene Reports》为circRNA在泌尿肿瘤领域的应用研究提供了重要范式。
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