乳酸化修饰在脓毒症相关急性肾损伤中的分子机制与免疫调控研究

【字体: 时间:2025年06月13日 来源:Clinical and Experimental Medicine 3.2

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  这篇综述通过整合转录组学和单细胞测序技术,系统揭示了乳酸化相关基因(LRGs)在脓毒症相关急性肾损伤(SA-AKI)中的表达特征与功能机制。研究鉴定出118个差异表达LRGs,发现其富集于RNA剪接、组蛋白去乙酰化(HDAC)和碳代谢通路,并通过共识聚类将SA-AKI分为两个具有显著免疫差异的分子亚型。机器学习筛选出关键基因PECR和TP53I3,单细胞分析显示其特异性表达于近端小管和髓袢细胞。该研究为SA-AKI的靶向治疗提供了新思路。

  

引言

脓毒症相关急性肾损伤(SA-AKI)是重症监护室常见的高死亡率并发症,其病理机制涉及氧化应激、炎症反应和细胞凋亡。近年来,乳酸化(lactylation)作为一种新型蛋白质翻译后修饰,在免疫代谢调控中的作用备受关注。本研究结合GSE232404转录组数据和GSE174220单细胞测序,首次系统解析了乳酸化相关基因(LRGs)在SA-AKI中的分子特征。

材料与方法

从GEO数据库获取10例样本(5例SA-AKI vs 5例对照)的转录组数据,筛选332个文献报道的LRGs。采用Limma包鉴定差异基因(adj.P.Val<0.05且|logFC|>2),CIBERSORT算法评估免疫浸润,ConsensusClusterPlus进行分子分型。通过WGCNA构建共表达网络,结合LASSO回归和随机森林算法筛选关键基因。单细胞数据经Seurat包质控,Harmony校正批次效应,UMAP降维后注释7种肾细胞类型。

结果

LRGs表达模式与共表达网络
共鉴定118个差异LRGs,热图显示其在SA-AKI组显著上调。共表达分析揭示HDAC2与TP53I3呈强正相关(r=0.58),而PECR与HDAC3负相关(r=-0.79)。

通路富集与免疫特征
GO分析显示LRGs富集于RNA剪接和组蛋白去乙酰化(FDR<0.05),KEGG提示碳代谢通路激活。免疫浸润显示SA-AKI组M0巨噬细胞(p=1.2×10-4
)和中性粒细胞(p=0.003)显著增加,CD4+
记忆T细胞亚群重分布。

分子亚型与免疫调控
共识聚类将SA-AKI分为Cluster1(高免疫浸润)和Cluster2(低免疫活性)。差异基因富集于细胞因子-受体相互作用通路(NES=2.1),其中CCL5在Cluster1中表达升高3.2倍(p<0.001)。WGCNA鉴定darkseagreen3模块与亚型高度相关(r=0.96)。

关键基因鉴定
机器学习交叉筛选出PECR(过氧化物酶体β-氧化相关)和TP53I3(p53应激响应基因)。转录因子分析显示二者受motif cisbp__M1413调控(NES=14)。单细胞图谱揭示PECR特异性表达于近端小管细胞(p<0.01),TP53I3在髓袢细胞富集(log2FC=4.3)。

讨论

乳酸化通过代谢重编程(如糖酵解增强导致的乳酸堆积)参与SA-AKI进展。PECR可能通过调节脂质过氧化影响肾小管上皮细胞损伤,而TP53I3可能通过p53信号介导细胞凋亡。研究局限性包括样本量较小和缺乏临床分期数据,未来需通过类器官模型验证LRGs功能。

结论

该研究构建了SA-AKI的乳酸化调控网络,提出PECR/TP53I3可作为潜在治疗靶点,为开发免疫代谢干预策略提供理论依据。

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