水稻环境响应中转录因子调控可变剪接(AS)的普适特征与分子机制

来自国内的研究团队通过水稻TENOR RNA-seq数据集，系统解析了环境胁迫下可变剪接(AS)的普适特征，发现bHLH/bZIP/HsfA2e 等转录因子(TFs)通过调控剪接因子(SFs)表达影响AS模式，揭示了TFs-PSIs-SFs级联调控网络，为植物环境适应性机制研究提供新视角。

　　

这项研究深入探索了水稻在环境胁迫下前体mRNA可变剪接(Alternative Splicing, AS)的奥秘。科研人员利用TENOR标准RNA-seq数据集，发现AS事件在胁迫响应中呈现显著的组织特异性（根与茎差异）、时间动态性以及不同胁迫间的共性特征。有趣的是，差异剪接基因(DASGs)与差异表达基因(DEGs)展现出截然不同的调控模式。

研究亮点在于揭示了大量DASGs编码的竟是剪接因子(Splicing Factors, SFs)和转录因子(Transcription Factors, TFs)本身！通过PSI(Percent Spliced In)值分析，发现TFs表达水平与AS事件存在显著相关性。特别值得注意的是，bHLH、bZIP和HsfA家族成员（如OsbHLH148、OsbZIP62和OsHsfA2e）的突变体在胁迫条件下表现出显著的AS模式改变。

更精妙的是，研究发现了TFs与SFs之间的"共舞"现象——它们的转录水平在非生物胁迫下呈现高度协同变化。这暗示着TFs可能通过双重机制调控AS：既直接改变自身剪接模式，又通过调控SFs的转录来间接影响下游基因的剪接决策。这项研究为理解植物如何通过"转录-剪接耦合"网络适应环境变化提供了分子蓝图。