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微生物接种剂与季节性干旱协同调控玉米根际微生物组促进铁吸收的机制研究
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年06月13日 来源:Environmental Microbiome 6.3
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本研究针对农业微生物接种剂(BMc)田间应用效果不稳定的问题,通过两年田间试验揭示了季节性干旱如何通过重塑根际微生物组(包括Comamonadaceae和Hypocreaceae等关键类群)增强玉米铁吸收能力。研究发现BMc(含Trichoderma harzianum OMG16、Bacillus atrophaeus ABi03和Pseudomonas sp. RU47)在干旱条件下显著上调ZmNAS3基因表达,促进铁吸收并缓解干旱胁迫,该效应与微生物组中siderophore合成基因(如dhbF、entB)的富集显著相关。成果发表于《Environmental Microbiome》,为气候变化背景下微生物接种剂的精准应用提供了理论依据。
随着气候变化加剧,干旱胁迫已成为限制农作物产量的主要因素。传统农业依赖化肥农药的高投入模式,不仅造成环境污染,还加剧了资源枯竭。在此背景下,利用植物有益微生物(Plant Growth-Promoting Microorganisms, PGPM)作为生物刺激剂成为可持续农业的重要策略。然而,微生物接种剂在田间应用中常出现效果不稳定的问题,其背后的环境调控机制尚不明确。特别是干旱等非生物胁迫如何影响接种剂与作物-微生物组的互作,成为当前农业微生物学研究的核心挑战。
为解决这一科学问题,来自德国 Julius Kühn研究所等机构的研究团队在《Environmental Microbiome》发表重要成果。该研究通过两年田间试验,系统解析了耕作方式、施肥强度与季节性干旱的交互作用如何影响有益微生物联盟(Beneficial Microorganism Consortium, BMc)的根际定殖效率及其对玉米生长的促进作用。研究发现干旱是决定BMc应用效果的关键因素,其通过特异性富集根际微生物组中具有铁载体(siderophore)合成能力的类群(如Comamonadaceae),显著提升玉米铁营养状况并缓解干旱胁迫。这一发现为开发气候智能型农业微生物技术提供了新思路。
研究采用多组学联用技术:1)田间试验设计包含两种耕作方式(翻耕MP与浅耕CT)和两种氮肥强度(常规Int与减量Ext)的长期定位试验;2)通过培养法(CFU计数)和宏基因组测序追踪BMc菌株(Bacillus atrophaeus ABi03、Pseudomonas sp. RU47和Trichoderma harzianum OMG16)的根际定殖动态;3)利用16S rRNA和ITS扩增子测序解析微生物群落结构;4)结合ICP-OES元素分析、qPCR基因表达检测(ZmNAS3等26个基因)和结构方程模型(SEM)建立微生物组-植物表型关联网络。
选择性招募有益微生物的年度差异
在经历春季干旱的2020年,BMc处理使玉米生物量提升31%(p<0.001),而降水正常的2021年无显著差异。宏基因组分析显示,2020年BMc处理组中细菌铁载体合成基因(如dhbF、entF)相对丰度显著高于2021年(p<0.05),且与玉米叶片铁浓度(87.9 vs 81.5 mg kg-1
)呈正相关。扩增子测序进一步鉴定出239个细菌ASV(主要属Comamonadaceae)和110个真菌ASV(主要属Hypocreaceae)与铁吸收显著相关(p<0.05),这些类群在干旱年份对BMc的响应更敏感。
微生物接种缓解干旱胁迫的分子机制
qPCR分析揭示BMc在干旱条件下特异性上调铁螯合相关基因ZmNAS3(log2
FC=0.53,p=0.012),同时下调胁迫响应基因(如ZmDREB2A)。结构方程模型证实铁、锌、钾是限制玉米生长的关键因素(p<0.05),其中铁浓度解释50%的生物量变异(R2
=0.50)。通过基因组注释发现,Comamonadaceae中Variovorax等菌株携带ACC脱氨酶(1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase)和铁载体合成基因簇,可能通过双重机制增强植物抗旱性。
耕作方式对微生物组调控的次要作用
尽管翻耕(MP)显著影响细菌β多样性(PERMANOVA R2
=9.7-10.0%,p<0.001),但其与BMc的交互效应(R2
=4.5-4.9%)远小于年度气候差异(R2
=20.9%)。值得注意的是,BMc在两种耕作体系下均能稳定定殖(细菌达107
CFU g-1
),表明环境适应性强的菌株可克服农业管理造成的微生物组扰动。
该研究首次阐明季节性干旱通过"微生物组-铁营养-植物抗逆性"级联反应放大BMc的促生效应。在实践层面,发现Comamonadaceae和Hypocreaceae可作为预测接种效果的生物标志物,而ZmNAS3基因表达水平有望成为评估田间效力的分子指标。理论层面,研究揭示了环境胁迫通过改变宿主-微生物互作优先级(如从营养竞争转向胁迫缓解),重新定向微生物组功能演替的生态学规律。这些认识为开发基于微生物组的精准农业技术提供了重要科学依据,尤其对气候变化背景下旱作农业的可持续发展具有指导意义。
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