耐万古霉素屎肠球菌血流感染菌株的基因组草图解析及其临床意义

来自中国的研究人员针对耐万古霉素屎肠球菌(VREfm)这一全球公共卫生威胁，开展了ST80型菌株的基因组测序研究。通过Illumina NovaSeq 6000平台测序和SPAdes组装，获得2.9 Mb基因组草图，鉴定出vanA型耐药操纵子及多重耐药基因，为临床治疗和流行病学监测提供重要依据。

　　

这项研究揭示了从四川内江东兴区人民医院血流感染患者体内分离的一株耐万古霉素屎肠球菌(VREfm)的基因组特征。通过高通量测序技术，研究人员构建了包含243个重叠群、总长2,915,356 bp的基因组草图，GC含量为37.66%。

该菌株被鉴定为新兴的ST80型，携带完整的vanA型耐药操纵子(包含vanA、vanH-A、vanR-A等7个基因)，通过改变细胞壁前体结构产生耐药性。基因组分析还发现多种耐药基因：介导氨基糖苷类耐药的aph(3')-IIIa和aac(6')-I，大环内酯类耐药基因msr(C)和erm(B)，以及四环素耐药基因tet(S)。

有趣的是，该菌株携带三个黏附素基因(ecbA、acm和sgrA)，这些"分子吸盘"可能增强其定植能力。药敏试验显示其对氨苄西林(MIC≥32 mg/L)、环丙沙星(MIC≥8 mg/L)等常用抗生素耐药，但对利奈唑胺(MIC=2 mg/L)保持敏感。

研究采用Illumina NovaSeq 6000平台获得577×超高测序深度，使用SPAdes软件组装，并通过FastANI验证与模式菌株DSM 20477^T
的ANI值达99.19%。这些发现为理解ST80型VREfm的全球传播机制和开发新型治疗策略提供了基因组学基础。