新型不动杆菌全基因组测序揭示血小板输注相关脓毒症暴发菌株的进化特征

来自美国CDC的研究人员针对2018-2023年血小板输注相关脓毒症暴发事件，通过Nanopore-Illumina混合测序技术完成一株潜在新种不动杆菌（Acinetobacter calcoaceticus-baumannii complex, ACBC）的全基因组测序（4.04 Mb，GC含量38.8%），发现其携带T4P、T6SS等毒力基因簇，系统发育分析表明该菌株构成ACBC中新分支，为输血安全监测提供重要分子溯源依据。

　　

在医疗领域持续引发关注的不动杆菌（Acinetobacter）家族又添新成员！美国疾控中心（CDC）的科学家们最近破解了一株引发输血相关脓毒症暴发的神秘细菌基因组。这株被暂时命名为"Acinetobacter sp. 2019-01-05"的菌株，在2018-2023年间导致多名接受单采血小板（apheresis platelets）输注的患者发生致命感染，其中三例不幸死亡。

研究人员采用"长短读长混合组装"的尖端策略——先用Illumina MiSeq平台获得高精度短读长（1.7百万条reads，93.7×覆盖度），再结合牛津纳米孔（ONT）长读长测序（平均读长14.5 kb）进行补全。最终获得的4.04 Mb环状基因组包含4条染色体，GC含量为38.8%，编码3,663个基因。

毒力基因分析发现这个"细菌刺客"装备精良：携带IV型菌毛（Type IV pili）相关基因pilB-pilU（90-97%相似度），可帮助黏附宿主；拥有VI型分泌系统（T6SS）的hcp、vgrG等效应蛋白基因（87-95%相似度）；还有参与生物膜形成的adeG外排泵（91%相似度）和csuA/B菌毛基因。这些"分子武器"或可解释其强大的致病性。

最令人惊讶的是系统发育分析：当把这株菌与351株ACBC参考基因组"同台竞技"时，它既不属于已知的鲍曼不动杆菌（A. baumannii），也不属于其他近缘种，而是独自构成一个进化分支，与鲍曼不动杆菌、鼻疽不动杆菌（A. nosocomialis）等形成姐妹群。平均核苷酸相似度（ANI）分析显示，其与最近缘的参考基因组相似度仅90.93%，远低于新种划分的95%阈值。

这项研究不仅为输血安全敲响警钟，更揭示了ACBC家族中潜在的新物种。研究人员已将基因组数据（登录号GCA_046529755.1）公开，为后续感染防控提供重要分子靶点。毕竟，要战胜这些"超级细菌"，首先得认清它们的"真面目"！