基于分子对接与动力学的临床药物库计算筛选：靶向神经纤维蛋白抑制的1型神经纤维瘤病治疗新策略

来自国际研究团队通过计算药物重定位策略，利用PyRx分子对接和GROMACS分子动力学模拟技术，从Zinc15临床化合物库中筛选出河豚毒素（Tetrodotoxin）作为神经纤维蛋白（NF1）新型抑制剂。该化合物与GLU981 、SER1561 等关键残基形成稳定相互作用，100 ns模拟显示复合物具有理想RMSD/Rg参数，为1型神经纤维瘤病（NF1）靶向治疗提供新思路。

　　

这项突破性研究采用计算机辅助药物发现（CADD）技术，对Zinc15数据库中临床阶段化合物进行系统性筛选，旨在攻克1型神经纤维瘤病（Neurofibromatosis type 1, NF1）的治疗难题。通过PyRx软件进行高通量分子对接，发现海洋生物毒素河豚毒素（Tetrodotoxin, ZINC000261527152）与神经纤维蛋白（neurofibromin）的Ras-GAP结构域产生显著结合活性，关键结合位点涉及GLU⁹⁸¹
-GLN⁹⁸⁵
活性口袋及SER¹⁵⁶¹
-ASN¹⁵⁶³
调控区域。

研究团队运用GROMACS力场完成100纳秒分子动力学（MD）模拟，复合物体系展现出优异的稳定性指标：均方根偏差（RMSD）<2?、回转半径（Rg）波动<0.5nm，溶剂可及表面积（SASA）变化证实结合界面具有理想的疏水特性。特别值得注意的是，碳氢键网络与常规氢键的协同作用，使该天然毒素分子展现出类似ATP竞争性抑制剂的结合模式。

虽然计算生物学结果令人振奋，但研究者强调需通过细胞实验验证其对Ras-MAPK信号通路的调控作用，并评估这种钠通道阻断剂在NF1治疗中的特异性。这项研究为罕见遗传病治疗开辟了新途径，同时展示了人工智能辅助的分子模拟技术在药物重定位（drug repurposing）领域的巨大潜力。