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基于重组酶聚合酶扩增与侧向层析技术(RPA-LFA)的IMO标准海洋病原菌快速检测方法开发
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年06月13日 来源:The Microbe CS0.7
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为解决压载水中IMO标准病原菌检测设备复杂、耗时长的问题,研究人员开发了结合重组酶聚合酶扩增(RPA)和侧向层析(LFA)的快速检测技术,成功实现37°C条件下20分钟完成V. cholerae、E. faecalis和E. faecium的高特异性检测,为海洋病原体现场监测提供新方案。
海洋运输是全球贸易的命脉,每年约100亿吨压载水在船舶间转移,这些水体中潜藏着3×1021
量级的细菌,包括国际海事组织(IMO)重点监控的霍乱弧菌(Vibrio cholerae)、粪肠球菌(Enterococcus faecalis)和屎肠球菌(E. faecium)。这些病原体不仅威胁海洋生态,更可能通过压载水排放引发公共卫生危机。然而传统检测方法依赖PCR等复杂技术,需昂贵设备和数日周期,难以满足港口快速检疫需求。
针对这一技术瓶颈,来自韩国海洋科学技术院的研究团队在《The Microbe》发表创新成果,开发出基于重组酶聚合酶扩增(RPA)与侧向层析试纸条(LFA)的联用技术。研究通过设计特异性引物探针系统,优化37°C恒温反应条件,结合CD样生物芯片实现自动化检测,仅需1小时即可完成病原体筛查。
关键技术包括:1) 针对ctxB/ddl基因设计带FAM/生物素标记的RPA引物探针;2) 使用合成DNA模板替代活菌进行安全实验;3) 建立30-50°C温度梯度与0-30分钟时间梯度的反应优化体系;4) 开发集成反应腔、废液腔和LFA检测区的CD样生物磁盘。
研究结果显示,37°C反应20分钟为最佳条件,LFA可在5-10分钟内可视化结果。灵敏度测试证实可检测300ng以下DNA模板,特异性实验表明与V. barjaei等近缘菌种无交叉反应。创新的CD-LFA设计实现"样本进-结果出"的一体化检测,电泳验证显示废液腔回收的扩增产物条带清晰。
该研究突破性地将RPA-LFA技术应用于海洋病原体监测领域,其价值体现在三方面:首先,摆脱对热循环仪的依赖,使检测成本降低90%;其次,将传统48小时的检测周期压缩至1小时,满足IMO对压载水实时监测的要求;最后,CD-LFA设计为现场检测提供标准化操作方案。研究者特别指出,该方法虽未纳入E. coli检测以避免nfo酶干扰,但为Enterococcus spp.建立了首个RPA-LFA检测标准,填补了该领域技术空白。未来研究需进一步验证实际水样中的检测效能,并扩展至其他海洋病原体的筛查体系。
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