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历史模式标本DNA测序与分子系统学解析:13种大型真菌的分类修订与命名整合
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年06月14日 来源:Mycological Progress 2.1
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为解决历史模式标本DNA降解导致的物种界定难题,研究人员采用Illumina基因组浅层测序技术,成功从13种大型真菌模式标本中获取ITS、nrLSU、TEF1、RPB1和RPB2序列。研究证实Acetabula purpurea等4种为独立物种,提出Cordyceps szemaoensis属间转移至Perennicordyceps,并揭示Endophallus与Phallus的属级合并关系,建立1个新组合和8个新异名,为真菌分类学提供关键分子证据。
这项研究通过突破性技术将历史标本与现代分类学相衔接。面对百年珍藏真菌模式标本中高度降解的DNA,团队巧妙运用Illumina平台的基因组浅层测序(genome skimming)技术,从13个珍贵模式标本——包括紫色钟菌(Acetabula purpurea)、凉山虫草(Cordyceps liangshanensis)等——中成功捕获核糖体内部转录间隔区(ITS)、核糖体大亚基(nrLSU)及三个重要蛋白编码基因(TEF1α
、RPB1、RPB2)的48条关键序列。
分子系统树揭示惊人发现:紫红竹荪(Dictyophora rubrovolvata)实为Phallus属独立物种,而思茅虫草(C. szemaoensis)则应划归Perennicordyceps属。更引人注目的是,研究证实云南内鬼笔(Endophallus yunnanensis)与商业菌种"冬笋鬼笔"(P. dongsun)均为芳香鬼笔(P. fragrans)的晚出异名,而本世纪命名的三个Phallus种实为上世纪记载的巨盖鬼笔(P. megacephalus)的异名。
该工作不仅验证了基因组浅层测序在历史标本分子鉴定中的强大效能,更通过多基因联合分析解决了长期悬而未决的分类争议,为真菌资源开发利用提供了精准的"分子身份证"。研究提出的1个新组合和8个新异名建议,显著提升了模式标本的科学价值,对维护真菌命名体系的稳定性具有里程碑意义。
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