颅底脊索瘤免疫亚型鉴定及巨噬细胞浸润的预后价值研究

本研究针对颅底脊索瘤预后评估的临床难题，通过RNA测序和免疫组化分析77例患者样本，首次鉴定出两种免疫亚型（Cluster A/B），发现高浸润巨噬细胞（CD68+ /CD163+ ）的Cluster B亚型与不良预后显著相关（PFS: P<0.001）。研究揭示了TIME（肿瘤免疫微环境）异质性在脊索瘤精准治疗中的潜在价值，为免疫治疗靶点选择提供新依据。

　　

颅底脊索瘤是一种罕见却极易复发的恶性骨肿瘤，尽管手术切除是主要治疗手段，但复杂的解剖位置常导致切除不彻底。更棘手的是，97%的病例属于WHO分类中的经典型，传统病理分型对预后预测价值有限。近年来，随着肿瘤免疫微环境（TIME）研究的深入，科学家们发现免疫细胞浸润可能与脊索瘤复发密切相关——比如巨噬细胞可通过CCL5分泌促进肿瘤进展，而PD-L1抑制剂Pembrolizumab的临床试验也显示出部分疗效。但这些发现尚未转化为可靠的临床预测指标，亟需系统性研究揭示脊索瘤免疫特征与预后的关联。

北京天坛医院的研究团队在《Acta Neuropathologica Communications》发表的重要研究，通过对77例新鲜冻存肿瘤的RNA测序（RNA-seq）和261例组织芯片（TMA）的验证分析，首次建立了颅底脊索瘤的免疫分型体系。研究人员采用ssGSEA（单样本基因集富集分析）量化14种免疫/基质成分，通过无监督聚类将肿瘤分为免疫冷（Cluster A）和免疫热（Cluster B）两种亚型，并利用ESTIMATE、CIBERSORT、xCell等多算法交叉验证。关键发现是：富含巨噬细胞（尤其是M2型）的Cluster B患者，其无进展生存期（PFS）和总生存期（OS）显著缩短，这一结论在独立队列中通过CD68/CD163免疫组化得到确证（HR>3.4, P<0.001）。

关键技术方法
研究整合了RNA-seq（77例新鲜样本）和TMA（261例FFPE样本）双队列设计。通过ssGSEA计算免疫/基质评分进行无监督聚类，使用ESTIMATE评估肿瘤纯度，CIBERSORT/xCell解析免疫细胞亚群，并对51例配对样本进行CD3/CD68/CD163免疫组化验证。生存分析采用Kaplan-Meier和Cox比例风险模型，校正了肿瘤体积、切除范围等临床变量。

免疫亚型鉴定
基于251个免疫相关基因的ssGSEA评分，研究成功分离出两个稳定簇集：Cluster A（n=47）表现为免疫抑制微环境，而Cluster B（n=30）除中性粒细胞外所有免疫成分（特别是T细胞和巨噬细胞）均显著富集（P<0.001）。这种差异被ESTIMATE算法计算的免疫/基质评分（P<0.001）以及CD68⁺
（P=0.026）、CD163⁺
（P=0.013）巨噬细胞的免疫组化定量所证实。

通路特征解析
GSEA分析揭示Cluster B特异性激活IL-6/JAK/STAT3等免疫通路（FDR<0.05），同时伴随EMT（上皮间质转化）和WNT/β-catenin等促癌通路上调。值得注意的是，唯一1例低分化脊索瘤（PDC）被归类至Cluster B，且TMA队列中所有PDC病例均显示巨噬细胞高浸润，暗示免疫微环境可能与肿瘤恶性度相关。

临床预后关联
在平均4年随访中，Cluster B患者的PFS和OS较Cluster A缩短50%以上（P<0.05）。多因素分析显示，即使校正手术切除程度等混杂因素后，免疫分型仍是独立预后指标（HR=1.974, P=0.055）。在更大规模的TMA队列中，CD68⁺
或CD163⁺
细胞>5%的患者5年生存率下降30%（P<0.004），这一发现在PDC亚型中尤为突出。

研究意义与展望
该研究首次在脊索瘤中建立了具有临床可操作性的免疫分型系统，将巨噬细胞浸润确定为关键预后标志物。这不仅解释了既往观察到的PD-L1抑制剂部分疗效机制——高免疫浸润亚型可能更适于免疫治疗，还为开发靶向CD47/SIRPα等巨噬细胞检查点的联合疗法提供了理论依据。局限性在于单中心设计和小样本量，未来需通过多中心研究验证分型稳定性。随着免疫治疗在肉瘤领域的进展，这项研究为脊索瘤精准免疫治疗策略的制定奠定了重要基础。