剪接调控蛋白质异构体翻译后修饰多样性的系统分析及PTM-POSE工具开发

【字体: 时间:2025年06月14日 来源:Cell Systems 9.0

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  来自某研究团队(作者单位未明确)的科学家们开发了名为PTM-POSE的计算工具,旨在解决剪接异构体与翻译后修饰(PTM)互作研究的瓶颈问题。该研究系统揭示了剪接通过排除PTM位点(32%)或改变修饰侧翼序列(2%)调控蛋白质功能的双重机制,并发现ESRP1相关剪接与前列腺癌中SGK1信号通路的潜在关联,为癌症靶向治疗提供新思路。

  

这项突破性研究通过开发PTM-POSE(翻译后修饰投影至剪接事件)计算工具,首次系统解析了剪接如何重塑蛋白质异构体的翻译后修饰(PTM)景观。研究团队发现,选择性剪接主要通过两种方式影响PTM:完全剔除修饰位点(占比高达32%)或微妙改变PTM周围的氨基酸环境(占2%)。

在机制探索中,科学家们捕捉到剪接包含度与磷酸化修饰水平的显著相关性。更令人振奋的是,ESRP1调控的剪接事件与前列腺癌关键激酶SGK1
的信号传导存在潜在关联,这为理解癌症发生提供了新的分子视角。

该工具还能预测PTM介导的蛋白质互作网络重构和激酶-底物调控重编程,揭示了剪接与PTM协同调控细胞功能的精妙机制。所有分析工具和数据均已开源,助力全球科研人员深入探索这个新兴交叉领域。

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