基于孟德尔随机化和生物信息学分析揭示肝内胆管癌肿瘤微环境中耗竭CD8+ T细胞相关生物标志物的鉴定

这篇研究通过整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）、加权基因共表达网络分析（WGCNA）和贝叶斯解卷积（BayesPrism）技术，系统解析了肝内胆管癌（iCCA）肿瘤微环境（TME）中耗竭CD8+ T细胞（Tex）的分子特征及其免疫逃逸机制。研究发现Tex显著富集于iCCA微环境，并鉴定出UQCRH、HINT1等关键基因及PNO1、AKR1C5P等潜在治疗靶点，为iCCA免疫治疗策略优化提供了新思路。

　　

引言

肝内胆管癌（iCCA）作为原发性肝癌中侵袭性最强的亚型，其发病率逐年上升且预后极差，5年生存率仅约9%。当前治疗手段如手术和化疗效果有限，亟需探索新的生物标志物和免疫治疗靶点。近年研究发现，CD8⁺
T细胞耗竭（Tex）在肿瘤免疫逃逸中起关键作用，但其在iCCA中的具体机制尚不明确。

方法

研究整合了GEO数据库的scRNA-seq数据（GSE138709、GSE189903）和GWAS数据（GCST90043859），利用scPagwas算法计算性状相关评分（TRS），并通过贝叶斯解卷积分析细胞组成。WGCNA构建基因共表达网络，结合孟德尔随机化（SMR）筛选关键基因。

结果

1. 细胞亚群鉴定：scRNA-seq揭示了iCCA微环境中7类细胞亚群，其中Tex和上皮细胞TRS评分最高，提示其与疾病进展密切相关。
2. 关键基因发现：scPagwas分析发现UQCRH、HINT1等基因与Tex显著相关，WGCNA进一步筛选出594个Tex相关基因，其中PNO1和AKR1C5P通过SMR验证为iCCA风险基因。
3. 免疫微环境特征：高Tex组表现出更强的免疫抑制（TIDE评分升高）和髓系抑制细胞（MDSC）浸润，且PBRM1突变频率达16%，可能影响免疫治疗响应。

讨论

Tex通过上调PD-1/CTLA-4等检查点分子促进免疫逃逸，而PNO1和AKR1C5P的调控机制可能成为干预新靶点。研究局限性在于缺乏体内实验验证，未来需扩大样本种族多样性。

结论

该研究为iCCA的免疫治疗提供了理论依据，PNO1和AKR1C5P的发现为个体化治疗开辟了新方向。