新疆达坂城盐湖嗜盐链霉菌C11-1全基因组测序分析揭示新型抗菌代谢潜力

来自中国新疆的研究人员对达坂城盐湖分离的嗜盐链霉菌C11-1进行全基因组测序分析，揭示其7296298 bp线性基因组含30个次级代谢产物合成基因簇，其中4个为全新发现。该菌对耐药金黄色葡萄球菌(S. aureus)和表皮葡萄球菌(S. epidermidis)具强抗菌活性，通过COG/KEGG/GO数据库注释5534/2310/4383个CDS，为开发新型抗生素提供重要资源。

　　

这项研究解密了源自新疆达坂城盐湖的嗜盐链霉菌(Streptomyces) C11-1的完整基因组图谱。这个神奇的微生物拥有一份长达7,296,298碱基对(bp)的线性基因组说明书，其中71.38%的页面由G+C这对黄金搭档书写。科学家们在这本说明书里发现了6,402个蛋白质编码基因(CDS)，包括18个rRNA基因、71个tRNA基因和34个ncRNA基因组成的"翻译小分队"。

更令人兴奋的是，抗微生物"武器工厂"预测软件antiSMASH在基因组中发现了30个次级代谢产物合成基因簇，其中21个与已知基因簇有1-90%的相似度，而4个完全陌生的基因簇可能是制造新型抗生素的"秘密配方"。功能注释显示，5,534个CDS在COG数据库、2,310个在KEGG通路、4,383个在GO数据库中找到自己的"工作岗位"。

这个菌株最拿手的本领是对抗耐药菌——它能有效抑制顽固的金黄色葡萄球菌(S. aureus)和表皮葡萄球菌(S. epidermidis)。通过基因组相似性(ANI)分析发现，它与环形链霉菌(S. anulatus) JCM 4721的相似度达到89.37%，就像微生物界的"远房表亲"。这些发现为开发对抗超级细菌的新武器打开了宝库大门。