DDX3X解旋酶三聚体协同机制揭秘:RNA解旋与ATP酶活性的分子互作新视角

【字体: 时间:2025年06月16日 来源:Biochemical and Biophysical Research Communications 2.5

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  本研究针对DEAD-box解旋酶DDX3X在RNA代谢和疾病中的关键作用,通过构建N端截短体D1D2-C,揭示了其三聚体协同解旋RNA的双重机制:三个分子协同解旋RNA但仅两个参与ATP水解。研究发现D1结构域E186残基和C端尾部是寡聚化关键,为癌症和HIV-1治疗靶点开发提供新思路。

  

在细胞的生命活动中,RNA的解旋过程如同解开纠缠的丝线,需要精密分子机器的参与。DEAD-box解旋酶家族成员DDX3X正是这样的"分子剪刀",它在RNA代谢、癌症发展和HIV-1感染中扮演关键角色。然而,这个蛋白质如何通过多个分子协同工作来解开RNA双链,一直是未解之谜。更令人困惑的是,其C端尾部像"指挥棒"一样调控着整个解旋过程,但具体机制尚不清晰。

美国国立卫生研究院国家癌症中心的研究团队在《Biochemical and Biophysical Research Communications》发表重要成果。他们创造性地构建了N端截短的DDX3X变体D1D2-C,通过质量光度法、X射线晶体学和Hill协同性分析等技术,首次揭示了DDX3X三聚体协同解旋RNA的分子机制。研究发现三个D1D2-C分子像"三人小组"一样合作解开RNA,但只有两个成员消耗ATP能量;而关键的E186残基和C端尾部如同"分子胶水",促成两种不同的亚基界面形成。

关键技术包括:质量光度法测定蛋白质-RNA复合物分子量;X射线晶体学解析D1D2:dsRNA:ADP复合物2.4?结构;Hill方程分析协同效应;定点突变验证E186功能;使用含16bp dsRNA和25nt 3'突出端的RNA底物。

【RNA底物诱导的D1D2-C三聚化】
质量光度法显示D1D2-C在RNA存在时形成三聚体,分子量约240kDa,证实了RNA诱导的寡聚化现象。

【克隆与定点突变】
通过Gibson组装技术构建D1D2-C(131-662)表达载体,并制备E186A突变体。突变体实验证明E186是D1:D1界面形成的关键残基。

研究结论表明:DDX3X通过前所未有的三分子协同机制解旋RNA,其中第三个"旁观者"分子不参与ATP水解但增强解旋效率;C端尾部像"多功能开关",既能介导C:C相互作用,又能稳定D1:D1界面;E186残基突变可将协同性从三分子降为两分子,为设计靶向抑制剂提供精确靶点。

这项研究不仅阐明了DDX3X的工作机制,更揭示了DEAD-box解旋酶家族的新型协同模式。在应用层面,针对E186或C端尾部的干预策略可能成为治疗DDX3X相关癌症和病毒感染的新途径。特别值得注意的是,三分子协作中"旁观者"角色的发现,挑战了传统认为所有协同分子必须参与能量消耗的认知,为理解蛋白质寡聚化功能开辟了新视角。

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