综述:类标签环肽——蛋白质整合与生物工程应用中的模块化亲和元件

【字体: 时间:2025年06月16日 来源:Bioorganic & Medicinal Chemistry 3.3

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  (编辑推荐)本综述系统阐述了环肽(cyclic peptides)作为"类标签"(tag-like)分子在药物开发和蛋白工程中的独特优势:结构稳定性、高靶标亲和力(KD)、抗蛋白酶解特性及模块化应用潜力。重点探讨了二硫键桥接、金属介导连接等环化技术,以及噬菌体展示(phage display)筛选策略,为开发新型蛋白亲和标签(affinity tags)和双环肽(bicyclic peptides) therapeutics提供了创新视角。

  

Abstract
环肽凭借其独特的结构稳定性和靶标结合特异性,已成为药物开发和生物工程领域的重要工具。相较于线性肽,环状构象能显著降低熵值、增强刚性,并抵抗蛋白酶降解。目前全球获批的120种治疗性肽类药物中,46%为环肽结构,包括抗真菌药Rezafungin(Rezzayo?)和肾脏血管活性药Terlipressin(TerlivazTM)。

Cyclic Peptides originate from diverse sources
自然界蕴藏着丰富的环肽资源:从土壤杆菌Bacillus brevis分离的Tyrocidine(1939年发现的首个环状抗生素),到蜗牛毒液中的α-芋螺毒素(靶向烟碱型乙酰胆碱受体),再到植物Rubiaceae家族的kalata B1(含三对二硫键的抗菌环肽)。现代技术则通过组合库筛选(如链霉亲和素结合环肽的亲和力比线性版本提高3倍)和基因编码策略(如含非天然氨基酸的环肽)拓展了其多样性。

Potential "Tag-like" cyclic peptides
符合"类标签"标准的环肽需满足三大特征:仅含蛋白源性氨基酸、分子量<5 kDa、可逆结合靶蛋白。典型案例包括:

  1. 噬菌体展示筛选的中性亲和素结合环肽,用于单步蛋白纯化
  2. 模拟冰结合蛋白的环肽标签,实现低温条件靶向捕获
  3. 光控环肽开关,通过顺反异构调控蛋白互作
    这类模块化元件能像"分子乐高"般整合至抗体或治疗蛋白,增强其细胞穿透性(如环状穿膜肽)或靶向精度。

Conclusions and future directions
环肽正重塑"大小分子疗法"的边界:其结合界面虽不足抗体CDR区的1/10,却能实现nM级亲和力。未来突破点在于:
• 开发无痕环化技术(避免非天然氨基酸引入)
• 构建多价环肽库(如双环肽同时靶向PD-1/CTLA-4)
• 整合AI预测与微流控筛选(加速高稳定性环肽发现)
这类"智能标签"有望在蛋白检测、药物递送和合成生物学中开辟新维度。

CRediT authorship contribution statement
多学科团队合作完成了本项研究:Zirui Zhu与Louisa Girard负责概念构建与数据分析,Andrew Poweleit参与可视化设计,Haowei Ma等贡献了关键文献调研。所有作者声明无利益冲突。

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