胃癌印戒细胞癌新型分子亚型的蛋白质组学解析:预后标志物与治疗靶点的发现

【字体: 时间:2025年06月16日 来源:Genes & Diseases 6.9

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  推荐:针对胃癌印戒细胞癌(GSRCC)分子特征不明、治疗靶点匮乏的难题,浙江大学肿瘤医院团队通过10,000例临床队列结合112例FFPE样本的DIA-MS蛋白质组分析,首次绘制GSRCC最大规模蛋白质图谱,鉴定代谢(S-Mb)、微环境失调(S-Me)、迁移(S-M)和增殖(S-PF)四种亚型,发现PRDX2/DDX27预后标志物及PFAS/EIF2S3/EIF6/NFKB2靶点,分子对接证实neratinib的抑瘤潜力,为LMT-GSRCC精准治疗提供新策略。

  

胃癌印戒细胞癌(GSRCC)是一种具有独特病理特征的胃癌亚型,其细胞内充满黏液形成"印戒"样结构,近年来发病率持续攀升。这类肿瘤不仅侵袭性强、易转移,还对现有化疗、靶向治疗普遍耐药,患者中位生存期仅15.9-20.8个月。更棘手的是,约70%的GSRCC患者属于"三阴性"类型——即HER2阴性、EBV阴性且错配修复功能正常(pMMR),临床上被称为"缺乏药物治疗的GSRCC"(LMT-GSRCC),几乎没有任何靶向治疗选择。传统组织学分类已无法满足精准医疗需求,而既往研究多聚焦于常见胃癌亚型,对GSRCC的分子特征特别是蛋白质组层面的认知仍存在巨大空白。

为破解这一困局,浙江大学肿瘤医院联合中国科学院杭州医学研究所的科研团队开展了一项里程碑式研究。研究人员首先对2010-2019年间收治的11,899例胃癌患者进行严格筛选,最终纳入5422例形成多中心队列,其中包括276例纯GSRCC(印戒细胞占比≥50%)。通过压力循环技术(PCT)联合数据非依赖性采集质谱(DIA-MS),团队对112例高纯度GSRCC(印戒细胞≥70%)的FFPE样本进行深度蛋白质组分析,构建了包含7322个蛋白质的组织特异性肽段谱库,这是迄今最全面的GSRCC蛋白质组图谱。相关成果发表在《Genes》杂志,为这一难治性肿瘤的精准诊疗带来突破性进展。

研究采用多组学技术联合作战:基于10年临床队列的回顾性分析筛选典型病例;通过PCT辅助的DIA-MS技术实现FFPE样本高通量蛋白质检测;利用非负矩阵分解(NMF)算法进行分子分型;结合GeneMANIA网络分析和IPA通路富集解析生物学机制;最后通过分子对接和体内外实验验证靶点。

GSRCC是预后极差的特殊胃癌亚型
分析显示GSRCC患者5年生存率仅48.9%,显著低于普通腺癌(63.1%)。这类患者呈现年轻化、女性居多、酗酒吸烟率低等独特流行病学特征,且多发生于胃远端。蛋白质组检测揭示肿瘤与癌旁组织存在1985个差异蛋白,涉及线粒体功能障碍、氧化磷酸化等通路,其中PRDX2下调与DDX27上调最具预后价值。

四大分子亚型揭示异质性本质
通过NMF聚类发现GSRCC存在四种蛋白亚型:代谢型(S-Mb)富集能量代谢通路,预后最佳;微环境失调型(S-Me)与免疫抑制相关;迁移型(S-M)表现出细胞外基质重塑特征,患者生存期最短;增殖型(S-PF)则高表达细胞周期相关蛋白。值得注意的是,这些亚型与传统HER2/EBV/MSI分型无重叠,凸显蛋白质组分类的独特价值。

双标志物验证指引临床决策
在独立验证队列中,抗氧化蛋白PRDX2的低表达与DEAD-box解旋酶DDX27的高表达分别对应不良预后,风险比(HR)达1.895和0.088。免疫组化证实两者可作为可靠的分子标签,其中PRDX2可能通过调节氧化应激抑制肿瘤,而DDX27则可能促进核糖体生物合成驱动癌变。

LMT-GSRCC的精准破解方案
针对79例"三阴性"难治病例,研究进一步细分出遗传不稳定型(C-Gi)、代谢型(C-Mb)和迁移-增殖型(C-Pf)三个集群。其中C-Pf组高表达PARP1/TOP2A等增殖标志物,预后最差。通过严格筛选,团队锁定PFAS、EIF2S3、EIF6和NFKB2四个可成药靶点,其中磷酸核糖甲酰甘氨脒合成酶(PFAS)作为嘌呤合成关键酶尤为突出。

老药新用展现治疗潜力
分子对接显示FDA已批准的泛HER抑制剂neratinib与PFAS结合能最佳,其通过氢键网络精准锚定Asn等关键氨基酸。体外实验证实neratinib可浓度依赖性地抑制NUGC-4细胞活力(IC50
=2.5μM),将迁移能力压制至对照的18%。动物实验中60mg/kg剂量使肿瘤体积缩小67%,且未引起显著肝肾毒性。

这项研究首次系统描绘了GSRCC的蛋白质组全景,建立的分子分型体系超越了传统病理学分类,特别是对LMT-GSRCC这一临床"盲区"提出了靶向解决方案。发现的PRDX2/DDX27标志物可直接应用于预后评估,而neratinib的"老药新用"策略则有望快速转化临床。值得一提的是,团队构建的GSRCC特异性肽段数据库为后续研究提供了宝贵资源,其采用的PCT-DIA技术方案也为FFPE样本的蛋白质组研究树立了新标准。这些突破不仅填补了领域空白,更开创了基于蛋白质组学的精准治疗新时代,为攻克这一"癌中顽石"带来曙光。

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