
-
生物通官微
陪你抓住生命科技
跳动的脉搏
新型N-烷基取代5-氯靛红衍生物的合成、晶体结构及电子特性研究:多技术联用揭示其非线性光学与溶剂化潜力
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年06月16日 来源:Journal of Molecular Structure 4.0
编辑推荐:
本研究通过合成新型5-氯-1-戊基吲哚啉-2,3-二酮衍生物(CPI),结合X射线单晶衍射(XRD)、密度泛函理论(DFT)计算和COSMO-RS溶剂化模型,系统揭示了N-烷基化对靛红骨架结构、电子分布及溶剂化行为的影响。研究发现,该化合物具有显著的电子离域特性、潜在非线性光学响应(βtot )及氢键受体能力,为药物设计和功能材料开发提供了新思路。
靛红(Isatin)及其衍生物因其结构可修饰性和广泛的生物活性,长期以来在药物化学和材料科学领域备受关注。从抗菌、抗肿瘤到非线性光学材料,这类化合物的潜力不断被挖掘。然而,一个关键问题始终悬而未决:如何在保留靛红核心药理活性的同时,通过精准的结构修饰调控其电子特性、溶解性和分子间相互作用?特别是N-烷基化和卤素取代的协同效应,对分子堆积模式、反应位点分布以及溶剂化行为的影响机制尚不明确。
针对这一科学问题,由Imam Mohammad Ibn Saud伊斯兰大学领衔的研究团队设计并合成了一种新型N-戊基取代的5-氯靛红衍生物(5-chloro-1-pentylindoline-2,3-dione,CPI),通过多学科交叉方法揭示了其结构-功能关系。相关成果发表在《Journal of Molecular Structure》上,为理性设计靛红类化合物提供了重要理论依据。
研究人员采用X射线单晶衍射确定绝对构型,通过密度泛函理论(DFT)在B3LYP/6-311+G(d,p)水平计算电子结构参数,结合自然键轨道(NBO)、福井函数(Fukui function)和分子静电势(MESP)分析活性位点,并运用COSMO-RS模型模拟水、乙醇和DMSO中的溶剂化行为。
晶体结构解析
XRD显示CPI的吲哚啉-2,3-二酮核心呈平面构型,戊基链以全反式构象(all-trans conformation)垂直延伸。关键键长如C=O(1.21 ?)与DFT计算结果高度吻合,验证了理论方法的可靠性。这种构象可能影响分子堆积和膜渗透性。
电子特性研究
DFT计算表明,氯取代和N-烷基化协同增强了环系统的电子离域。NBO分析揭示羰基氧与相邻键的显著超共轭效应(σ→π*相互作用达20 kcal/mol),而MESP显示负电势集中在羰基氧区域,提示其为潜在氢键受体位点。值得注意的是,该化合物表现出中等第一超极化率(βtot
= 8.7×10-30
esu),暗示其二阶非线性光学(NLO)应用潜力。
反应活性预测
福井函数分析指出,环氮和羰基氧区域具有亲核性(f-
值最高),而某些环碳原子(如C4和C6)呈现亲电性,这为后续衍生化反应提供了位点选择依据。
溶剂化效应
COSMO-RS模拟显示CPI在不同溶剂中具有稳定的溶剂化能(水:-9.3 kcal/mol),其中羰基氧是主要的氢键作用位点。该分子在DMSO中的溶解度高于水,这与戊基链引入的疏水性一致,这种两亲性可能优化其生物利用度。
这项研究的创新性在于首次系统阐明了N-戊基-5-氯靛红的构效关系:烷基链不仅通过空间效应影响分子堆积,还通过诱导效应改变电子分布;氯原子则增强了π-π堆积和极性。这种多尺度理解对开发新型抗菌剂(通过调控膜渗透性)或NLO材料(通过优化βtot
)具有指导价值。
未来研究可基于此工作,进一步探索不同链长烷基取代的构效规律,或通过引入其他杂环构建更复杂的药物候选分子。该团队建立的"晶体结构-理论计算-溶剂化模型"三联分析方法,也为其他杂环化合物的理性设计提供了可借鉴的研究范式。
生物通微信公众号
知名企业招聘