新型多靶点Sec61抑制剂KZR-261的临床前表征:广谱抗肿瘤活性与机制研究

【字体: 时间:2025年06月16日 来源:The Journal of Pharmacology and Experimental Therapeutics 3.1

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  本研究针对Sec61转运体这一新兴抗癌靶点,开发了具有差异化抑制特性的小分子化合物KZR-261。通过结构优化克服天然产物类抑制剂的耐受性问题,该化合物通过特异性结合Sec61α侧门(R66/N300位点),选择性阻断PD-1/IL-2/HER3等促瘤因子的内质网(ER)转运,激活未折叠蛋白反应(UPR),在多种肿瘤模型中展现单药及联合PD-1抑制剂的显著疗效,并已完成I期临床试验(NCT05047536)。

  

在肿瘤治疗领域,靶向蛋白质合成通路正成为突破性方向。内质网转运通道Sec61作为调控30%人类蛋白质组进入内质网的关键门户,其抑制剂可通过阻断促瘤因子(如受体酪氨酸激酶、免疫检查点分子)的生物合成实现多维度抗肿瘤效应。然而天然来源的Sec61抑制剂(如apratoxin A、mycolactone)存在两大瓶颈:一是对Sec61客户蛋白(clientome)的无差别抑制导致严重毒性,二是药代动力学性质不佳阻碍临床转化。这些局限呼唤新一代具有选择性抑制特性的小分子问世。

Kezar Life Sciences的研究团队通过创新性药物设计,开发了结构优化的Sec61抑制剂KZR-261及其前体KZR-834。研究首先建立基于Gaussia荧光素酶(Gluc)标记信号肽(SP)的高通量筛选体系,发现先导化合物CADA的衍生物通过关键结构修饰——包括三氮环十二烷核心的(S)-甲基化及磺酰胺基团改造,使抑制活性提升25-50倍。冷冻电镜(CRYO-EM)3.1?分辨率结构解析揭示:KZR-261通过磺酰胺基团与Sec61α的Q127/N300形成氢键网络,稳定侧门闭合构象,其独特的二甲基苯胺磺酰基伸入通道孔环,而芳基哌嗪臂占据plug结构域侧隙,这种结合模式区别于已知抑制剂。

研究采用多组学联用策略:

  1. 定量蛋白质组学分析显示KZR-261选择性抑制2-5%的Sec61客户蛋白(2463/6367),显著富集于分泌型及I/II型跨膜蛋白;
  2. 流式细胞术验证其对PD-1/IL-7R等免疫检查点的剂量依赖性抑制(IC50
    20-100nM);
  3. 转录组学发现敏感细胞系(如多发性骨髓瘤H929)特异性激活IRE1-XBP1/eIF2α-ATF4-CHOP通路;
  4. 346株肿瘤细胞筛选显示广谱活性(中位IC50
    0.39μM),尤对血液肿瘤(骨髓瘤IC50
    133nM)及实体瘤(胰腺癌BxPC-3 IC50
    92nM)有效;
  5. 人源化PD-1小鼠模型中,KZR-261(7.5mg/kg IV每周)联合pembrolizumab实现100%肿瘤消退,显著优于单药。

关键发现包括:
Sec61α突变体验证靶点特异性
R66I/N300A突变使Sec61完全抵抗KZR-261抑制,证实其作用依赖于经典结合口袋。

差异化客户抑制谱
相较于天然抑制剂apratoxin A(46/46客户IC50
<5nM),KZR-261对176个测试客户显示梯度抑制(39%客户IC50
<100nM),这种"多靶点但非泛抑制"特性解释其良好耐受性。

ER应激的双刃剑效应
敏感细胞系H929呈现基础ER伴侣蛋白(BiP/calnexin)高表达,KZR-261处理4小时即诱发IRE1磷酸化及XBP1剪接,与蛋白酶体抑制剂carfilzomib(CFZ)联用显示协同效应(Bliss指数>0.25)。而耐药株U266虽能被联合方案逆转,但单独处理未见UPR激活,提示ER应激是敏感性标志非绝对致死机制。

临床转化价值
I期试验(NCT05047536)证实KZR-261在恶性实体瘤患者中安全性良好,剂量下实现疾病稳定。研究还揭示敏感肿瘤的分子特征——转录/翻译相关通路激活(如Reactome蛋白分泌模块),为精准医疗提供生物标志物方向。

这项研究的意义在于:

  1. 首次报道进入临床阶段的Sec61抑制剂,突破天然产物毒性瓶颈;
  2. 阐明"选择性多客户抑制"新范式,通过结构优化平衡疗效与安全性;
  3. 揭示Sec61抑制与免疫治疗的协同机制,为联合策略提供理论依据;
  4. 建立从SP报告基因到冷冻电镜结构的全链条靶点验证体系,为后续药物开发提供模板。论文发表于《The Journal of Pharmacology and Experimental Therapeutics》,为靶向蛋白质转运的抗肿瘤药物开辟了新赛道。
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