综述：RNA相关核凝聚体——细胞核调控RNA的枢纽

这篇综述深入探讨了非编码RNA（ncRNA）通过液-液相分离（LLPS）形成核凝聚体的分子机制及其在基因调控和疾病中的作用，重点解析了XIST、NEAT1等支架RNA与含固有无序域（IDR）的RNA结合蛋白（RBP）的协同作用，为癌症、神经退行性疾病等提供了新的治疗靶点。

　　

RNA相关核凝聚体：细胞核调控RNA的枢纽

Abstract
非编码RNA（ncRNA）通过调控染色质结构和基因表达参与细胞过程与应激响应。近年研究发现，ncRNA功能与RNA介导的核凝聚体密切相关——这类无膜细胞器通过液-液相分离（LLPS）形成，为基因组组织和转录调控提供特化微环境。核凝聚体紊乱与神经退行性疾病、癌症等密切相关。高分辨率显微技术和测序技术揭示了核凝聚体的亚结构及其RNA-蛋白质互作网络，证实ncRNA可作为支架招募含IDR的RBP，触发LLPS并形成功能凝聚体。

Introduction
生物分子凝聚体是通过LLPS形成的动态无膜区室，通过浓缩特定分子促进生化反应。在细胞核中，核仁、核斑（nuclear speckles）和旁斑（paraspeckles）等凝聚体协调DNA组织、RNA转录及转录后调控。例如，旁斑通过隔离含反向Alu重复（IRAlus）的mRNA实现基因沉默。核凝聚体功能紊乱可导致癌症、神经退行性疾病和发育障碍，凸显其在维持细胞稳态中的关键作用。

RNA-associated nuclear condensates and their core structural RNAs

Long noncoding RNAs
长链非编码RNA（lncRNA）如XIST和NEAT1是核凝聚体的核心支架：

• XIST（17,000 nt）通过重复序列招募PRC1/2、SPEN等沉默因子，形成巴氏小体（Barr body）以失活X染色体。XIST缺失会导致X连锁基因异常表达，引发发育障碍和癌症。
• NEAT1_2（23,000 nt）通过三重螺旋结构招募NONO、SFPQ等蛋白形成旁斑核心-壳结构，隔离转录因子和IRAlus-mRNA以调控基因表达。NEAT1在阿尔茨海默病（AD）和肌萎缩侧索硬化（ALS）中异常高表达，可能通过过度滞留RNA导致神经元功能障碍。

Small nuclear RNA and mRNA
核斑富含小核RNA（snRNA）和pre-mRNA，储存剪接 machinery（如U1/U2 snRNP）。组蛋白基因座小体（HLB）依赖U7 snRNA加工组蛋白pre-mRNA，其破坏会导致细胞周期异常和白血病。

Satellite repeat RNAs
卫星重复RNA如HSATII和HSATIII在应激下激活：

• HSATII在癌症中形成CAST小体，通过MeCP2招募HDAC沉默抑癌基因；
• HSATIII在热休克时形成核应激小体（nSB），调控应激基因剪接，其异常与神经退行性疾病相关。

Orphan nuclear condensates
如Sam68核小体（SNB）和CS小体依赖未知RNA维持结构，可能通过MIAT lncRNA参与RNA加工。

IDRs and RNAs in nuclear organization
含IDR的RBP（如FUS、SFPQ）通过多价相互作用触发LLPS。例如，NEAT1通过IDR介导的蛋白互作形成液滴，而RNA二级结构（如G4四链体）增强相分离效率。

Future perspectives
APEX标记和超分辨显微技术将揭示孤儿凝聚体的RNA组分。增强子RNA（eRNA）和环状RNA（circRNA）可能通过LLPS调控转录凝聚体，为疾病治疗提供新靶点。

Conclusion
RNA通过序列互补性和IDR介导的相互作用驱动核凝聚体形成，在基因调控和疾病中发挥核心作用。未来研究需进一步解析其分子机制及治疗潜力。