犬圆环病毒的进化动态与密码子偏好性分析：揭示全球传播与宿主适应性

本研究针对犬圆环病毒（CanineCV）跨宿主传播风险，通过宏基因组测序和生物信息学分析，揭示了其5大进化分支（China-I、China-II等）、重组驱动进化机制及1950年挪威狐源起源，首次量化其对人源适应性高于已知宿主，为潜在人畜共患风险提供预警。论文发表于《Molecular Phylogenetics and Evolution》，为Circoviridae科病毒防控策略奠定理论基础。

　　

研究背景
圆环病毒（Circovirus, CV）作为最小的动物DNA病毒，其成员如猪圆环病毒（PCV）已对畜牧业造成重大损失。2011年发现的犬圆环病毒（CanineCV）近年频繁突破物种屏障，相继感染貉、猫等新宿主，且与免疫抑制症状相关。更令人担忧的是，80%的CanineCV序列来自人类亲密伴侣——犬，而现有研究对其进化历史和传播风险认知仍碎片化。华南农业大学微生物实验室团队在流浪犬血清中检出32.4%的高阳性率，促使他们系统性解析该病毒的全球传播规律与潜在公共卫生威胁。

技术方法
研究整合了华南地区流浪犬庇护所的34份血清样本（通过宏转录组测序发现11例阳性），结合NCBI中276条全球序列，使用BEAST进行时空溯源、RDP5检测重组事件、CodonW分析密码子使用偏好性，并建立宿主适应性指数模型评估跨种感染风险。

研究结果

1. 样本检测与测序
在深圳流浪犬庇护所中通过PCR确认11例CanineCV阳性样本，获得3条新全基因组序列（GenBank登录号PP781941-PP781943）。

2. 病毒组成与分布
全球276条序列的系统发育分析揭示CanineCV存在5大分支：China-I、China-II、Cosmopolitan、EA（东亚）和SEA（东南亚）分支，其中中国分支呈现地域特异性。

3. 时空起源与传播
贝叶斯进化分析表明，CanineCV最早可追溯至1950年7月的挪威赤狐（Vulpes vulpes），随后通过跨大陆重组事件扩散至欧亚及美洲。

4. 密码子使用偏好性
病毒Rep蛋白（复制相关蛋白）密码子适应指数（CAI）显示其对人类密码子系统的适应性显著高于犬、猫等已知宿主，暗示潜在人畜共患可能。

5. 重组分析
检测到China-I与Cosmopolitan分支间广泛重组，重组热点集中在Cap蛋白（衣壳蛋白）编码区，这种“模块化进化”加速了宿主范围扩张。

结论与意义
该研究首次构建了CanineCV的全球传播图谱，证实重组是其进化核心驱动力。尤为关键的是，通过宿主适应性指数量化评估，发现CanineCV对人类细胞的适配度超越现有宿主，这一发现为“病毒溢出”风险提供了早期预警。尽管目前尚无人类感染报道，但鉴于其与PCV的遗传相似性及免疫抑制特性，需加强跨物种监测。研究不仅为Circoviridae科的进化机制提供新见解，也为新发人兽共患病的“One Health”防控策略提供了理论依据。