综述:生物学与生命科学中的非局部模型:来源、发展与应用

【字体: 时间:2025年06月16日 来源:Physics of Life Reviews 13.7

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  这篇综述系统阐述了非局部模型(Nonlocal Models)在生物系统(如细胞通讯、神经网络、疾病传播等)中的关键作用,涵盖从经典反应-扩散方程(RD)到分数阶模型(FODE)的理论框架,并探讨其在生态动力学、肿瘤建模(CSC)、生物传感(如压电材料)等领域的创新应用。文章特别强调了非局部性(Nonlocality)如何突破局部模型局限,为多尺度生物现象(如Peridynamics理论描述的骨断裂)提供更精准的数学描述。

  

生命科学中的非局部模型:跨越尺度的数学革命

2.1 均质与非均质系统

从图灵(Turing)提出的形态发生理论出发,经典反应-扩散方程(RD)通过扩散项(如Fick定律)与非线性反应项(如质量作用定律)的耦合,解释了斑马条纹等生物图案的形成。但传统RD模型(如Fisher-KPP方程)仅能描述短程相互作用,而真实生物系统(如细胞群体感知化学信号)往往涉及长程交互——这正是非局部模型的用武之地。通过引入卷积算子(如???u),模型可捕捉个体在空间域Ω中跨越多个细胞直径的相互作用,例如植物根系竞争养分或肿瘤细胞通过filopodia远程探测微环境。

2.2 单物种群体的非局部交互

以Fisher-KPP方程的修正为例:当资源消耗不仅依赖局部密度u(x,t),还受邻域加权平均(∫?(x-y)u(y,t)dy)影响时,系统可能产生传统模型无法预测的图灵斑图。这种非局部竞争机制在昆虫扩散(如风力传播种子)和癌症干细胞(CSC)迁移中尤为关键——例如,模型(3)中卷积项???un
可量化细胞群体对远处资源的掠夺效应。

2.3 时空非局部性

Britton模型(5)通过双重卷积ψ????u整合历史状态与空间关联,模拟了流行病传播中潜伏期(如COVID-19的冷链传播)或生态系统的记忆效应(如植被对过去干旱的响应)。这种时空耦合在脑动力学模型中尤为重要,例如癫痫发作时神经元集群的跨脑区同步活动。

2.4 细胞生物学与基因组学的非局部性

肿瘤异质性模型(6)通过非局部算子ψ(x,y,p)描述癌症干细胞(CSC)与普通肿瘤细胞的远程互作,而CRISPR/Cas9基因编辑中的脱靶效应也需非局部模型量化DNA断裂的远距影响。特别地,细胞力学中的分数阶微积分(如Caputo导数C
Dα
u)能精准刻画细胞膜的粘弹性记忆(记忆核t
/Γ(1-α))。

2.7 非局部流行病学模型

从Kermack-McKendrick的经典SIR模型(11)到COVID-19空间模型(13),非局部项(如∫βe
(x,y)E(y,t)dy)刻画了跨区域传播的接触网络。疫苗覆盖率η(x)的空间异质性分析揭示:即便在δe
(x)(病毒环境存活率)高的地区,非局部扩散算子D[·]仍可预测疫情热点的迁移路径。

2.11 模式形成的物理机制

在捕食者-猎物系统(21)中,非局部竞争(αu(1-???u/κ))会诱发螺旋波等复杂斑图,而三物种食物链模型(22)的“P型非局部性”(如ψ??w)解释了为何高迁移性中间捕食者能稳定生态系统。这些发现为生态保护(如非洲草原的植被-食草动物-狮子级联)提供了量化工具。

前沿展望

从量子点生物传感器(非局部介电响应)到皮质骨愈合(Peridynamics模拟),非局部模型正推动生命科学进入多尺度建模的新纪元。未来挑战包括:开发更高效的数值算法(如快速傅里叶变换加速卷积计算),以及整合单细胞测序数据构建个性化肿瘤生长预测模型。

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