广西芒果细菌性黑斑病菌(Xanthomonas citri pv. mangiferaeindicae) B3株全基因组解析:毒力与耐药机制新见解

【字体: 时间:2025年06月17日 来源:Microbiology Resource Announcements 0.7

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  来自广西的研究人员针对威胁芒果产业的细菌性黑斑病(Xanthomonas citri pv. mangiferaeindicae),通过ONT+Illumina混合测序技术完成B3株5.29 Mb基因组测序,揭示其含1条染色体和2个质粒的结构特征(GC含量64.5%),发现4,218个蛋白编码基因及286个假基因,为病原菌防控提供分子靶点。

  

科研人员从广西百色(23.93°N, 106.65°E)染病芒果叶片中分离出Xanthomonas citri pv. mangiferaeindicae B3株,经KC培养基(含40 mg/L头孢氨苄+20 mg/L春雷霉素)纯化后,通过16S rRNA基因测序(99.93%同源于EF989732.1)确认分类地位。

采用纳米孔(ONT)和Illumina双平台测序,经Flye软件整合获得5.17 Mb环状染色体(覆盖度238×)和两个质粒(85.6 kb/33 kb)。CheckM评估显示基因组完整度达97.9%,注释发现4,600个基因含6个rRNA和52个tRNA。特别值得注意的是,该菌株携带286个假基因,可能与其宿主适应性进化相关。

表型分析显示,该病原体通过产生胞外多糖(表现为黏液状菌落)和耐药基因(如质粒编码的β-内酰胺酶),导致芒果叶片出现典型黑斑病变。基因组数据已存入NCBI(BioProject: PRJNA1231277),为开发新型杀菌剂和抗病育种提供重要分子靶标。

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