基于HiBiT技术的活细胞mRNA翻译高通量监测系统开发及其在mRNA疗法优化中的应用

【字体: 时间:2025年06月17日 来源:Nucleic Acids Research 16.7

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  本研究针对mRNA疗法开发中缺乏蛋白特异性翻译监测工具的难题,剑桥大学团队创新性地将HiBiT(高亮度生物发光标签)技术应用于mRNA翻译动态研究。通过建立体外(兔网织红细胞裂解系统)和细胞(HEK293 LgBiT稳定株)双重检测平台,首次实现不同5'UTR结构、核苷酸修饰、poly(A)尾长等因素对特定蛋白编码mRNA翻译效率的实时量化。研究发现优化策略需根据目标蛋白特性定制,为mRNA药物设计提供了新型高通量筛选工具。

  

在生物医药领域,mRNA技术正从新冠疫苗向肿瘤疫苗、蛋白替代疗法等更广阔领域拓展。然而当前mRNA优化研究严重依赖GFP(绿色荧光蛋白)等报告基因,这些高度工程化的蛋白具有异常稳定的翻译特性,无法反映治疗性蛋白的真实表达规律。更棘手的是,现有翻译监测技术如多核糖体分析、Ribo-seq(核糖体测序)等存在操作复杂、无法实时监测等局限,严重制约了mRNA药物的开发效率。

剑桥大学药理学系Camilla Ascanelli*、Elsa Lawrence等研究者突破性改造HiBiT技术——一种仅含11个氨基酸的纳米荧光素酶片段,将其作为蛋白标签与目标蛋白共表达。当与细胞中稳定表达的LgBiT大亚基结合时,可产生实时生物发光信号。团队通过兔网织红细胞裂解物(RRL)体外翻译系统和HEK293-LgBiT细胞系,建立了从分钟级到18小时的全时程监测体系,并验证了其在人胚胎干细胞来源心肌细胞(hESC-CMs)等原代细胞中的适用性。

关键技术包括:1)构建含不同非编码元件的HiBiT标记mRNA文库;2)RRL体外翻译结合化学发光检测;3)LgBiT稳定表达细胞的活体发光监测;4)qRT-PCR验证mRNA稳定性与免疫原性;5)蛋白质印迹与生物发光双验证系统。

CAP和5'UTR的影响
研究发现CleanCap与ARCA(抗反向帽类似物)在体外翻译效率无差异,但CleanCap显著降低TLR3等免疫基因激活。通过设计MFE(最小自由能)达-46.89 kcal/mol的5'UTR发夹结构,证实细胞中严苛的二级结构会使翻译效率降低58.3%,而RRL系统无法反映这种差异,凸显细胞模型的重要性。

编码序列优化
比较eGFP-HiBiT与6种治疗相关蛋白发现:1)eGFP翻译效率超MYL3-HiBiT(肌球蛋白轻链)4.6倍;2)转录因子中Jun-HiBiT表达最高,Myc-HiBiT最低;3)YAP8SA-HiBiT(转录共激活因子突变体)呈现独特持续上升曲线。通过Myc T58A磷酸化位点突变和密码子适应指数(CAI)优化组合,使蛋白输出增加84%,证明"一刀切"的优化策略不适用于所有蛋白。

核苷酸修饰
pseudouridine(pU)修饰使Myc-HiBiT翻译提升61%,但对eGFP无显著影响。N1-methylpseudouridine(N1mU)虽降低免疫应答,但可能引起核糖体移码,提示修饰选择需权衡翻译效率与精确性。

poly(A)尾调控
40个腺苷酸(40A)即可保证有效翻译,80A与120A无显著差异。但3A尾因无法结合PABPC(多聚腺苷酸结合蛋白)导致mRNA快速降解,蛋白表达降低90%。

这项研究开创性地将HiBiT技术拓展至mRNA翻译领域,其核心价值在于:1)首次实现治疗蛋白特异性翻译动态追踪,打破依赖报告基因的局限;2)揭示优化策略需"量体裁衣",如Myc需要CAI优化而非MFE;3)建立的高通量平台可加速mRNA药物元件筛选。该成果发表于《Nucleic Acids Research》,为个性化mRNA疗法设计提供了不可替代的工具箱,尤其对半衰期短的转录因子类药物开发具有里程碑意义。

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