游离DNA链特异性特征揭示转录与甲基化足迹的分子标志

研究人员通过单链文库测序技术，首次系统揭示了健康人群与肺癌患者血浆游离DNA(cfDNA)的链特异性偏倚特征。该研究证实短片段cfDNA(<160bp)的链偏倚更显著，且与基因密度、CpG岛、低甲基化区域及线粒体非编码区密切相关，为无创检测提供了新型分子标记。

　　游离DNA(cfDNA)作为革命性的液体活检标志物，其双链测序已揭示核小体足迹特征，但单链层面的蛋白-DNA互作机制仍属空白。这项研究采用单链文库构建技术，通过对34名健康人血浆cfDNA的深度分析，首次绘制出染色体和线粒体基因组(mtDNA)的链特异性"分子地图"。

令人惊讶的是，短片段cfDNA(<160碱基)展现出更强的链偏倚性，这些偏倚区域在基因启动子、外显子、5'非翻译区(5'UTR)、3'非翻译区(3'UTR)及CpG岛富集如"分子灯塔"。更精妙的是，高CpG密度与低甲基化区域如同"表观遗传开关"，显著增强了链特异性信号。线粒体DNA分析则捕捉到非编码区独特的链偏倚模式，清晰勾勒出mtDNA复制与转录的"分子足迹"。

研究团队进一步解码了性别差异的基因层面特征，并在14例肺癌患者中发现了区别于健康对照的"分子指纹"。这些发现不仅为cfDNA生物学特性提供了全新认知，更开辟了无创诊断的新途径——通过解读cfDNA单链的"分子密码"，实现疾病特征的精准破译。