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胸腺嘧啶DNA糖苷酶高效切除8-氧代腺嘌呤的分子机制及其在基因组稳定性维护中的作用
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年06月17日 来源:Journal of Biological Chemistry 4.0
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本研究揭示了胸腺嘧啶DNA糖苷酶(TDG)对氧化损伤碱基7,8-二氢-8-氧代腺嘌呤(oxoA)的高效切除机制,通过单周转动力学实验发现TDG对G·oxoA对的催化效率(kmax /K0.5 )高达3919 μM-1 min-1 ,且活性受3'碱基和关键残基(H151/Y152)调控。该研究为理解氧化损伤修复提供了新视角,对癌症和衰老相关疾病研究具有重要意义。
DNA作为遗传信息的载体,其稳定性对生命活动至关重要。然而,活性氧(ROS)会攻击DNA碱基,产生具有致突变性和细胞毒性的损伤,如7,8-二氢-8-氧代腺嘌呤(oxoA)。这种氧化损伤不仅威胁基因组完整性,还与癌症、衰老等疾病密切相关。在哺乳动物细胞中,oxoA会导致A→C和A→G的突变,但对其修复机制的认识仍不充分。胸腺嘧啶DNA糖苷酶(TDG)作为碱基切除修复(BER)途径的起始酶,已知主要切除嘧啶类碱基如胸腺嘧啶(T)和尿嘧啶(U),但近期发现其对嘌呤损伤oxoA也表现出意外的高活性。为阐明这一现象的分子机制,来自美国的研究团队在《Journal of Biological Chemistry》发表了这项重要研究。
研究人员采用单周转动力学实验、pH依赖性分析和定点突变等技术手段,系统研究了TDG对oxoA的切除特性。通过构建含不同配对碱基(如G·oxoA、T·oxoA)的28bp双链DNA底物,结合高效液相色谱(HPLC)分析,定量测定了酶活性参数。
在"TDG对oxoA切除的催化效率"部分,研究发现TDG对G·oxoA对的催化效率(kmax
/K0.5
)高达3919 μM-1
min-1
,比对T·oxoA的活性高7300倍。这种差异主要源于底物亲和力(K0.5
)的25倍变化和最大活性(kmax
)的294倍差异。
"TDG切除oxoA依赖3'碱基"的研究显示,3'碱基对活性的影响呈现G??A>C>T的趋势。特别值得注意的是,对T·oxoA底物,3'碱基从G变为T会导致活性降低68倍,这种效应比G·oxoA底物(12倍)更为显著。
通过"oxoA切除的pH依赖性"实验,研究人员发现与TDG切除5-羧基胞嘧啶(caC)不同,oxoA切除在pH6.0-9.0范围内无明显变化,表明TDG通过稳定oxoA阴离子而非酸催化机制促进反应。
在"H151在催化oxoA切除中的作用"部分,H151A突变导致G·oxoA活性降低3倍,而对A·oxoA和C·oxoA的抑制更为显著(35倍和19倍)。有趣的是,该突变反而使G·T和G·U活性提高21倍和7倍,表明H151对不同底物具有选择性调控作用。
关于"Y152羟基在oxoA切除中的重要性",Y152F突变使G·oxoA活性降低3倍,对T·oxoA的抑制达16倍。更引人注目的是,Y152A突变导致所有底物活性急剧下降(103
-104
倍),表明其芳香环对酶功能至关重要。
这项研究首次全面揭示了TDG高效切除oxoA的分子机制,阐明了3'碱基偏好性和关键催化残基(H151/Y152)的作用模式。发现TDG通过稳定oxoA阴离子中间体而非质子化机制促进反应,这一发现拓展了对BER途径的认识。研究还揭示了H151对不同底物的差异化调控:在促进oxoA切除的同时抑制T/U切除,这种"双刃剑"特性可能有助于维持基因组稳定性。这些发现为理解氧化损伤修复与疾病的关系提供了新视角,对开发相关治疗策略具有重要指导意义。
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