基于同步DNA-RNA测序揭示中国肺癌患者MET外显子14跳跃突变谱及其临床意义

本研究针对非小细胞肺癌(NSCLC)中MET外显子14跳跃突变(METex14)检测方法的优化需求，通过11,330例中国患者队列比较了捕获法(CLC)和扩增子法(ALC)建库的DNA/RNA测序(NGS)效能。发现同步DNA-RNA NGS检测率最高达2.20%，揭示45种变异类型广泛分布于197bp区域，且在≥60岁、晚期患者和微卫星不稳定高(MSI-H)群体中显著富集。该研究为精准检测METex14提供方法学依据，对指导靶向治疗具有重要临床价值。

　　

肺癌作为占癌症死亡20%的"头号杀手"，在中国呈现高发态势。尽管靶向治疗为患者带来曙光，但MET外显子14跳跃突变(METex14 skipping)这类罕见驱动变异的检测仍面临挑战——现有DNA测序可能漏检复杂剪接事件，而中国人群的突变特征和检测策略缺乏系统研究。更棘手的是，这种突变会导致MET受体酪氨酸激酶持续激活，促进肿瘤进展，但临床常用的免疫组化(IHC)检测又存在特异性不足的缺陷。随着 savolitinib 等靶向药在中国获批，如何精准锁定METex14 skipping阳性患者成为关键科学问题。

为破解这一难题，中国医学科学院肿瘤医院联合多家机构开展了一项大规模研究。团队创新性地同步应用捕获法(CLC)和扩增子法(ALC)两种建库方式，对11,330例中国肺癌患者的组织样本进行DNA/RNA测序(NGS)对比，同时结合IHC检测c-MET蛋白表达。研究采用Illumina NS500平台实现2000×测序深度，通过生物信息学分析全面解析突变谱系，并运用χ²
检验评估临床特征相关性。

结果部分呈现三大突破性发现：

• 检测方法学突破
  同步DNA-RNA NGS以2.20%的检出率显著优于单一DNA检测(1.38%)，其中RNA测序单独检出率达2.11%。扩增子法(ALC)因引物覆盖不足，仅能检测30%的突变类型，而捕获法(CLC)可识别全部45种变异。特别值得注意的是，5例DNA阳性/RNA阴性样本经证实为假阳性，凸显RNA验证的必要性。

• 突变图谱特征
  突变热点广泛分布于c.2888-45至c.3028+11的197bp区域，包括内含子13的剪接受体(SA)位点、外显子14的Y1003/D1010位点等。D1010突变占比最高(46.9%)，而Y1003突变仅占3.5%。引人注目的是，肺肉瘤样癌的突变率高达15.79%，显著高于腺癌(1.56%)和鳞癌(1.47%)。

• 临床相关性
  ≥60岁患者突变率是年轻患者的3.3倍(p<0.0001)，穿刺活检样本检出率显著高于手术样本(2.40% vs 1.27%)。更令人惊讶的是，微卫星不稳定高(MSI-H)群体突变率飙升至14.71%(p<0.0001)，而c-MET蛋白过表达与突变无显著关联(IHC一致性仅6.7%)。

这项发表于《JTO Clinical and Research Reports》的研究具有双重里程碑意义：方法学上确立了同步DNA-RNA测序作为METex14 skipping检测的金标准，特别是揭示扩增子法的设计缺陷；临床上首次绘制了中国人群突变全景图，发现老年、晚期和MSI-H患者应优先检测。研究不仅为靶向治疗筛选提供精准工具，其揭示的MSI-H关联性更为免疫治疗策略制定带来新思路。随着NGS技术普及，该成果将推动肺癌分子分型进入"多组学联用"新时代，让更多患者从精准医疗中获益。